More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4070 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  79.69 
 
 		 469 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  80.94 
 
 		 469 aa  755    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  79.01 
 
 		 469 aa  765    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  80.13 
 
 		 469 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  80.55 
 
 		 486 aa  787    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  75.97 
 
 		 479 aa  754    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  78.6 
 
 		 472 aa  757    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  80.91 
 
 		 477 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  76.19 
 
 		 467 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  81.22 
 
 		 469 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  97.49 
 
 		 479 aa  936    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  76.19 
 
 		 467 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  79 
 
 		 476 aa  770    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  86.68 
 
 		 474 aa  853    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  79.87 
 
 		 468 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  78.44 
 
 		 474 aa  748    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  76.41 
 
 		 467 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  80.81 
 
 		 469 aa  793    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  989    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  80.13 
 
 		 471 aa  786    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  76.19 
 
 		 467 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  76.19 
 
 		 467 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  57.88 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  56.47 
 
 		 462 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  55.43 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  56.95 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  44.52 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  42.39 
 
 		 477 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  38.6 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  39.01 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  36.74 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.66 
 
 		 488 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  35.54 
 
 		 524 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  33.67 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  33.06 
 
 		 505 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.04 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  33.2 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 502 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  33.27 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  32.1 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.73 
 
 		 488 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.57 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.95 
 
 		 534 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.26 
 
 		 588 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.65 
 
 		 591 aa  94.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.93 
 
 		 502 aa  94.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 596 aa  93.6  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.79 
 
 		 608 aa  93.2  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.45 
 
 		 596 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.25 
 
 		 507 aa  91.3  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.24 
 
 		 596 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.49 
 
 		 483 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.65 
 
 		 589 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.3 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.24 
 
 		 597 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.83 
 
 		 482 aa  87.4  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25.89 
 
 		 597 aa  86.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 507 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.24 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.2 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.35 
 
 		 598 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.03 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.99 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.2 
 
 		 519 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  29.24 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.15 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  29.24 
 
 		 570 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.08 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.2 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.81 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  24.69 
 
 		 925 aa  80.1  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.62 
 
 		 925 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.71 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  27.69 
 
 		 570 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.88 
 
 		 589 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.25 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.08 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25 
 
 		 589 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  21.8 
 
 		 511 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.04 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  24.8 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.44 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.05 
 
 		 1005 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.81 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.35 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  31.34 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  25.76 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.19 
 
 		 569 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.34 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.93 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  25.76 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>