More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1217 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 164 aa  324  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  44.87 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.49 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  39.19 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  36.3 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 		 157 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.1 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  36.71 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.88 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.22 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  31.82 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  37.58 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  39.86 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  32.69 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  40.15 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.82 
 
 		 162 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  39.42 
 
 		 168 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  40.25 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  34.93 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.64 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  35.38 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.78 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  35.38 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  39.73 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.62 
 
 		 192 aa  93.2  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  39.29 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  34.62 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  39.44 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.84 
 
 		 163 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  32.45 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.33 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.85 
 
 		 184 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.96 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  40.3 
 
 		 197 aa  90.5  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.25 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.29 
 
 		 185 aa  90.5  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 199 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1897  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  38.57 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0955  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.37 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2104  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 160 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.29 
 
 		 170 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.56 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0026  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.25 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  35.56 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.9 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0061  Holliday junction resolvase  37.06 
 
 		 185 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317029  normal  0.843846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  32.03 
 
 		 200 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1573  Holliday junction resolvase  30.19 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  37.04 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  36.49 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 		 190 aa  87.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 180 aa  87.4  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.04 
 
 		 174 aa  87.4  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  37.68 
 
 		 175 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.5 
 
 		 192 aa  87  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  35.51 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  36.15 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  32.08 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  32.31 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  35.25 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.12 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  34.78 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  30.43 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  32.31 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  30.43 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  30.43 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  36.3 
 
 		 232 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  39.19 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  36.49 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  36.3 
 
 		 198 aa  84.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  38.03 
 
 		 188 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  40.71 
 
 		 199 aa  84.3  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>