More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0955 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0955  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 166 aa  336  7e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.46 
 
 		 156 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  37.41 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  44.53 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  42.97 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  41.41 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  36.3 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.19 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  41.36 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.31 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 		 180 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  44.22 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  43.54 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  39.84 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  41.5 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  39.69 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  42.75 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 284 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  42.18 
 
 		 275 aa  101  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  40.82 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  39.06 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 207 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  35.57 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  37.41 
 
 		 171 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  38.28 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.05 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  36.24 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.51 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  36.72 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  37.88 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  37.88 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.9 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  37.88 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  37.88 
 
 		 173 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.92 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  37.12 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  40.14 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_002620  TC0789  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00672819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  35.16 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.41 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  37.41 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.6 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.57 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.01 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.23 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1289  Holliday junction resolvase  39.84 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4063  Holliday junction resolvase  42.31 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  36.73 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.06 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  35.94 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.91 
 
 		 173 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  35.94 
 
 		 189 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  36.73 
 
 		 168 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>