More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1289 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1289  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  86.13 
 
 		 232 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  87.28 
 
 		 198 aa  277  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  80 
 
 		 175 aa  254  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  77.01 
 
 		 178 aa  246  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  77.01 
 
 		 175 aa  243  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  76.61 
 
 		 172 aa  237  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  66.26 
 
 		 169 aa  194  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  61.68 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  62.87 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0902  Holliday junction resolvase  68.59 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  63.41 
 
 		 167 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  61.74 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  60.71 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  66.03 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  66.03 
 
 		 189 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  64.29 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  59.41 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  60.71 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  56.17 
 
 		 168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  57.41 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  66.88 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  62.75 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  62.42 
 
 		 207 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.96 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2328  Holliday junction resolvase  66.88 
 
 		 217 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0343755  normal  0.15621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1230  Holliday junction resolvase  63.4 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  60.24 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  59.26 
 
 		 175 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.44 
 
 		 164 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 169 aa  164  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  56.44 
 
 		 169 aa  165  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0964  Holliday junction resolvase  59.2 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1103  Holliday junction resolvase  61.44 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.788041  normal  0.52984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.6 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2141  Holliday junction resolvase  48.45 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  45.34 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44.79 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  54.04 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  44.72 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 174 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  47.88 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  49.09 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.51 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  49.34 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.91 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  47.77 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  46.75 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  43.03 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  49.34 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 		 275 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  48.08 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  49.02 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  49.7 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  49.11 
 
 		 186 aa  128  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  47.77 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  46.41 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  44.38 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.82 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  46.06 
 
 		 182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  50 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  46 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  42.59 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.05 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  47.53 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0992  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.67 
 
 		 206 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0391793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  46 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2324  Holliday junction resolvase  48.7 
 
 		 166 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.747333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36710  Holliday junction resolvase  46.05 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  47.53 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>