More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0142 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.88 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  46.84 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  40.65 
 
 		 167 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 175 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.31 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  41.29 
 
 		 184 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3217  Holliday junction resolvase  42.04 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.571528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1211  Holliday junction resolvase  43.31 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3604  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.758164  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0926  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 189 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.66838  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0962  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 189 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00555421 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1647  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1704  Holliday junction resolvase  42.68 
 
 		 173 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.723247  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.35 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0902  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.577145 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0004  Holliday junction resolvase  42.19 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000281167  normal  0.194479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4170  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 232 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  41.14 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2906  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.21 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  40.37 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.54 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3179  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  40.26 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  40.62 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  38.99 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  37.74 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  39.1 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0002  Holliday junction resolvase  43.75 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38.16 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.41 
 
 		 183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 181 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  42.58 
 
 		 175 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 174 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  41.56 
 
 		 180 aa  113  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  41.29 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  37.97 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1433  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 		 183 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  41.4 
 
 		 188 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0285  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 		 189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  38.61 
 
 		 173 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1900  Holliday junction resolvase  37.97 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000300533  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2078  Holliday junction resolvase  37.97 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000308371  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.67 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.2 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  40.99 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  36.02 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  41.45 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1955  Holliday junction resolvase  37.97 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.873797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2431  Holliday junction resolvase  37.34 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  36.48 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.22 
 
 		 172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2328  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 217 aa  107  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0343755  normal  0.15621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0930  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 207 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.811793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  40.51 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>