More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0789 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0789  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 170 aa  350  8e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00672819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  41.29 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.01 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.71 
 
 		 163 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.53 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3491  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  32.9 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0008  Holliday junction endonuclease RuvC  36.36 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  39.49 
 
 		 181 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  39.49 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.9 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.21 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.46 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  35.9 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.77 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  39.51 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.35 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.35 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  35.26 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.21 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 171 aa  104  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  37.25 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.53 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  34.62 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.71 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.34 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  37.65 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  39.61 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  37.5 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.66 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1937  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00155576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  36.77 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  37.5 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  34.84 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.51 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.9 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  31.65 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0681536  normal  0.335061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 180 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 182 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.13 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 180 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2188  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.98 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240809  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0955  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 166 aa  97.4  8e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 184 aa  97.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 173 aa  97.1  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_002978  WD0142  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.47 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  35.71 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  35.71 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  35.48 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 180 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.84 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  38.52 
 
 		 189 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  38.31 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  33.13 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  37.82 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  33.73 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  35.8 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  36.88 
 
 		 186 aa  95.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1087  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 		 169 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>