More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0761 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0761  trigger factor  100 
 
 		 502 aa  942    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.187431  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  24.94 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  26.7 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  25.72 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.93 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  24.19 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  25.44 
 
 		 431 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  23.85 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  26.43 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  25.86 
 
 		 446 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12170  trigger factor  29.39 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0614  trigger factor  25.88 
 
 		 474 aa  107  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000543621  normal  0.981656 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  25.06 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  25.22 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  20.91 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  23.45 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  24.69 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  25.51 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09030  trigger factor  26.03 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.001374  normal  0.491462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  24.77 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  22.6 
 
 		 428 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  24.51 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  23.31 
 
 		 438 aa  100  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  21.63 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  25.4 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  27.27 
 
 		 481 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  22.78 
 
 		 443 aa  97.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  26.19 
 
 		 484 aa  96.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2160  trigger factor  25.5 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000432452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  26.26 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  24.4 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  22.94 
 
 		 428 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1850  trigger factor  26.65 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00394566  normal  0.0360337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  26.7 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  25.73 
 
 		 465 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  22.31 
 
 		 427 aa  93.6  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  25.85 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3480  trigger factor  24.84 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0955  trigger factor  26.48 
 
 		 447 aa  91.3  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  21.9 
 
 		 425 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  28.47 
 
 		 478 aa  90.1  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  23.95 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  26.55 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  21.64 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3518  trigger factor  27.3 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  23.61 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  23.61 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  23.76 
 
 		 428 aa  87.4  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  22.77 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  29.63 
 
 		 450 aa  87.4  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  21.78 
 
 		 425 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  21.78 
 
 		 425 aa  87  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2406  trigger factor  25.65 
 
 		 469 aa  87  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0022242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  21.32 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  23.66 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7296  trigger factor  26.13 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1576  trigger factor  26.35 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09870  trigger factor  28.47 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.478528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  26.97 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  22.04 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0323  trigger factor  22.76 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3584  trigger factor  25.45 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0954  trigger factor  29.05 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.928041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3579  trigger factor  25.45 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.652355  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0736  trigger factor  26.26 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.45082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3652  trigger factor  25.45 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134701  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  25.31 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1392  trigger factor  26.29 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323159  normal  0.446961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  22.56 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  21.9 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2566  trigger factor  25.32 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  25.31 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  22.57 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  23.92 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1369  trigger factor  31.49 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.684255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1480  trigger factor  21.7 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.29 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09080  trigger factor  27.01 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.985719  normal  0.0224029 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  26.7 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  25.43 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1118  trigger factor  27.75 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  22.72 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  24.2 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  26.07 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  26.24 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  22.45 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.21 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  22.56 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12487  trigger factor  24.73 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3661  trigger factor  25.17 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.805979  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1854  trigger factor  25.51 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.689753  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  24.29 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2739  trigger factor  26.73 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138547  decreased coverage  0.00279907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  24.48 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  25.06 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>