142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3926 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  100 
 
 		 323 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  92.21 
 
 		 322 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  91.28 
 
 		 322 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4016  transcriptional regulator-like protein  60 
 
 		 323 aa  354  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.620781  normal  0.983747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5754  hypothetical protein  29.48 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0624  transcriptional regulator-like protein  30.82 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21970  predicted transcriptional regulator  31.25 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.375543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0581  transcriptional regulator-like  32.65 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0608  transcriptional regulator-like protein  32.65 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.588838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0616  transcriptional regulator-like protein  32.31 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.501695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1294  regulatory protein, DeoR  27.69 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2317  transcriptional regulator-like protein  27.86 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143606  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.83 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2467  transcriptional regulator protein-like protein  27.57 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0469709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.25 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1201  hypothetical protein  27.45 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.334695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2609  hypothetical protein  26.3 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000144716  normal  0.0873123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1363  YobV  25.58 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.396054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0437  hypothetical protein  25.99 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4871  hypothetical protein  30.45 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0785474  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.44 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14000  predicted transcriptional regulator  32.71 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0168164  normal  0.101985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2250  putative transcriptional regulator protein  27.45 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1438  hypothetical protein  26.97 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2687  transcriptional regulator-like protein  31.4 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4096  Helix-turn-helix type 11 domain protein  26.19 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  25.24 
 
 		 663 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0063  hypothetical protein  19.16 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4455  hypothetical protein  27.92 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495976  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  27.49 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2181  transcriptional regulator-like protein  24.88 
 
 		 663 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1880  hypothetical protein  27.64 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  23.76 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0827  hypothetical protein  23.88 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.236202  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1200  transcriptional regulator-like  30.56 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.386828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5861  hypothetical protein  25.96 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0615  putative DeoR-family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2250  hypothetical protein  27.46 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0118565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.75 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11950  predicted transcriptional regulator  29.2 
 
 		 699 aa  53.9  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.308253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0812  hypothetical protein  24.34 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0970  transcriptional regulator-like protein  26.07 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.3 
 
 		 332 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  23.2 
 
 		 324 aa  52.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  22.62 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0998  transcriptional regulator  23.77 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2992  helix-turn-helix, type 11  33.61 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2368  hypothetical protein  27.46 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  20.8 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0607  putative DeoR-family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 334 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2057  transcriptional regulator-like protein  39.76 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090135  normal  0.188447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2651  hypothetical protein  26.88 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2316  DeoR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 331 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000471902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1826  transcriptional regulator protein-like protein  30.64 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.71 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  20.4 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2958  hypothetical protein  28.85 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000014666  hitchhiker  0.00431859 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  20.72 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  20 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  20 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1825  hypothetical protein  23.85 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2673  hypothetical protein  43.75 
 
 		 698 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.749079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2650  transcriptional regulator-like  27.72 
 
 		 323 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18550  predicted transcriptional regulator  28.12 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110092  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0559  transcriptional regulator  21.37 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18560  predicted transcriptional regulator  30.74 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0049611  normal  0.0116825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.66 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1866  transcriptional regulator protein-like protein  29.64 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  0.291628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4054  Helix-turn-helix type 11 domain protein  33.33 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.58 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.91 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0716  hypothetical protein  19.92 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5785  transcriptional regulator protein-like protein  27.08 
 
 		 687 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0684  hypothetical protein  20.32 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5862  transcriptional regulator protein-like protein  30.41 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.167693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.31 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3553  helix-turn-helix, type 11  29.85 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3403  transcriptional regulator-like protein  26.86 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0101274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1778  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.79 
 
 		 352 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1001  hypothetical protein  22.65 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0580  DeoR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.4 
 
 		 321 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.22 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.11 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1244  HTH domain family  22.65 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0913  hypothetical protein  22.5 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0351983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.01 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  43.14 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0049  hypothetical protein  23.08 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.607165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  35.24 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13990  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 348 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0412748  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12130  hypothetical protein  26.11 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0209407  normal  0.896855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  27.46 
 
 		 230 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  27.46 
 
 		 230 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2058  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  0.181699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2698  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.9 
 
 		 323 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>