37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_0827 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_0827  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.236202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0812  hypothetical protein  94.8 
 
 
327 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1441  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25 
 
 
333 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0944  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  23.84 
 
 
330 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.001663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1013  hypothetical protein  27.15 
 
 
245 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2780  Helix-turn-helix type 11 domain protein  24.32 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00079876  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0494  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  25.08 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3051  transcriptional factor  23.55 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430784  normal  0.0169917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3926  transcriptional regulator-like  23.88 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0956  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.86 
 
 
327 aa  53.1  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0841  hypothetical protein  24.37 
 
 
351 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.189594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3086  transcriptional regulator, putative  25.16 
 
 
334 aa  52.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0269  transcriptional regulator protein-like protein  22.57 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.08 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2797  putative transcriptional regulator  23.2 
 
 
339 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.58 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4066  transcriptional regulator-like protein  23.22 
 
 
322 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.652063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  23.17 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  22.29 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0382  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.85 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.117118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0660  transcriptional regulator, putative  21.64 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4034  transcriptional regulator-like protein  23.33 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2154  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.76 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2986  hypothetical protein  22.12 
 
 
433 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.178567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1808  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  24.46 
 
 
327 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.22 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3029  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  24.92 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  20.99 
 
 
315 aa  45.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.74 
 
 
324 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3644  hypothetical protein  27.32 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16096  normal  0.19013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2004  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.63 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.532666  normal  0.656208 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.65 
 
 
351 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1421  hypothetical protein  21.96 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.182129 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2252  transcriptional regulator protein-like protein  24.23 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  22.62 
 
 
327 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2241  transcriptional regulator-like protein  24.4 
 
 
350 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  24.4 
 
 
237 aa  42.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>