More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3016 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_3016  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  59.76 
 
 		 265 aa  288  7e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 259 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  61.32 
 
 		 267 aa  280  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  52.48 
 
 		 258 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  53.78 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  56.61 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  53.56 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  52.28 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  50.81 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1961  ABC transporter related  47.33 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3497  ABC transporter related  53.53 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  51.22 
 
 		 302 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  50.61 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  47.79 
 
 		 261 aa  229  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  53.1 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  44.72 
 
 		 254 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  46.77 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  46.37 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  44.86 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  46.12 
 
 		 273 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1016  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2343  ABC transporter related  45.38 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0523  ABC transporter related  45.49 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.310884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  48.59 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  44.17 
 
 		 359 aa  197  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22670  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.47 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0996  ABC transporter related  43.98 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0022  ATPase  42.34 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  41.06 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03182  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.501645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5099  ABC transporter related  42.74 
 
 		 362 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0528619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1254  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 357 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0999833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  42.98 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  43.03 
 
 		 265 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2743  ABC transporter related  45.87 
 
 		 272 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.132977 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0986  ABC transporter related  43.15 
 
 		 361 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0968  ABC transporter related  43.15 
 
 		 361 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51873  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  42.92 
 
 		 333 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2844  ABC transporter related  46.28 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  191  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  45.64 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  44.81 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  43.15 
 
 		 333 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2049  ABC transporter ATP-binding protein  46.06 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1680  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0627  ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00990626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3499  ABC transporter related  40.49 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.756482  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  44.12 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.74 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0578  ABC transporter related  44.03 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.206439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1354  ABC transporter related  43.8 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1434  methionine import ATP-binding protein MetN  41.8 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00844706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1349  ABC transporter related  41.08 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  41.49 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2343  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 252 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0100  ABC transporter related  40.57 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0480  ABC transporter related  45.9 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4716  ABC transporter related  43.62 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592299  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0141  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0633689  normal  0.467714 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1029  hypothetical protein  40.27 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0159  ABC transporter related  49.32 
 
 		 263 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03690  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, ATPase component  41.08 
 
 		 378 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.839011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1504  ABC transporter related  45.9 
 
 		 283 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  43.98 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0366  ABC transporter related  41.7 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2194  ABC transporter related  41.35 
 
 		 281 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0566123  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0071  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 279 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2806  ABC transporter related  41.84 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1223  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04770  ABC transporter, ATP binding component  46.03 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326188  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2316  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184477  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  42.34 
 
 		 269 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0742  ABC transporter ATP-binding protein  42.21 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0752  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 397 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0157  ABC transporter related  49.32 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0179  ABC transporter related  42.02 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1374  ABC transporter related  42.74 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  43.93 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1628  ABC transporter related  42.11 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387649 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  39.92 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1914  ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.94 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1155  ABC transporter related  44.81 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0314  ABC transporter ATP-binding protein  39.42 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2811  ABC transporter related  41.49 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0091  PP-loop family protein  40.5 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0135509  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1840  ABC transporter related  46.5 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  42.28 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6242  ABC transporter, ATPase subunit  41.49 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1127  ABC transporter related protein  40 
 
 		 421 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1527  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.330803  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0118  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.568497  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2949  ABC transporter related  41.49 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.85186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3963  ABC transporter related  36.82 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2900  ABC transporter related  41.08 
 
 		 304 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  40.17 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>