116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2474 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2474  hypothetical protein  100 
 
 
1369 aa  2778    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.291418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2805  hypothetical protein  26.62 
 
 
1317 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467826  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0653  hypothetical protein  23.39 
 
 
1308 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0907804  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0687  protein of unknown function DUF490  22.69 
 
 
1308 aa  102  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0688  protein of unknown function DUF490  22.32 
 
 
1308 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0698  hypothetical protein  23.5 
 
 
1310 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125559  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  25.31 
 
 
1406 aa  78.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  21.25 
 
 
1462 aa  75.1  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  23.48 
 
 
1325 aa  74.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  21.63 
 
 
1256 aa  72.4  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  27.12 
 
 
1392 aa  72.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1788  hypothetical protein  24.75 
 
 
1568 aa  72  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.420849  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  29.33 
 
 
1398 aa  72  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0342  hypothetical protein  27.39 
 
 
2322 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  30.58 
 
 
1382 aa  69.3  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  24.01 
 
 
2032 aa  65.1  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  20.56 
 
 
1229 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.5 
 
 
1485 aa  64.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  24.6 
 
 
1550 aa  64.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  20.77 
 
 
1308 aa  62.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  25.07 
 
 
2140 aa  61.6  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  23.11 
 
 
1377 aa  61.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.68 
 
 
1485 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0240  hypothetical protein  24.71 
 
 
2049 aa  60.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.930824  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.2 
 
 
1262 aa  60.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  22.82 
 
 
1352 aa  60.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  21.13 
 
 
1223 aa  60.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  20.05 
 
 
1226 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  24.41 
 
 
1869 aa  59.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  25.36 
 
 
1500 aa  58.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  22.83 
 
 
1283 aa  58.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  21.86 
 
 
1221 aa  58.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  26.43 
 
 
1441 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  25.28 
 
 
1243 aa  58.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  25.43 
 
 
1319 aa  58.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  21.61 
 
 
1221 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  27.89 
 
 
1395 aa  57.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  20.88 
 
 
1224 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  20.88 
 
 
1224 aa  56.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  22.92 
 
 
1290 aa  56.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  20.88 
 
 
1206 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17710  hypothetical protein  21.46 
 
 
1430 aa  55.1  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  21.26 
 
 
1232 aa  55.1  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  30.83 
 
 
1206 aa  55.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.33 
 
 
1218 aa  54.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  21.48 
 
 
1401 aa  54.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0814  protein of unknown function DUF490  22.29 
 
 
1101 aa  55.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.14 
 
 
1299 aa  54.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  22.61 
 
 
1259 aa  53.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  24.78 
 
 
1463 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3491  hypothetical protein  21.81 
 
 
1215 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2878  hypothetical protein  23.86 
 
 
1829 aa  53.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.41175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  21.76 
 
 
1256 aa  53.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  24.78 
 
 
1463 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  52.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  23.42 
 
 
1530 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  19.85 
 
 
1451 aa  52  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  52  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  31.47 
 
 
1783 aa  52  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  22.62 
 
 
1510 aa  52  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  22.7 
 
 
1515 aa  51.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  20.87 
 
 
1489 aa  51.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  20.62 
 
 
1224 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  20.72 
 
 
1362 aa  51.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  21.93 
 
 
1249 aa  51.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  21.51 
 
 
1304 aa  50.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  22.87 
 
 
1246 aa  50.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  20.8 
 
 
1184 aa  50.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  20.8 
 
 
1184 aa  50.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  21.57 
 
 
1404 aa  50.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  22.96 
 
 
1226 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  25.24 
 
 
1423 aa  50.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.28 
 
 
1448 aa  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  20.83 
 
 
1319 aa  49.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2994  protein of unknown function DUF490  22.57 
 
 
1813 aa  49.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  21.04 
 
 
1297 aa  49.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18431  hypothetical protein  25.27 
 
 
1478 aa  48.9  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  31.25 
 
 
1937 aa  48.9  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  23.16 
 
 
1578 aa  48.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  22.32 
 
 
857 aa  48.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  47.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22.81 
 
 
1258 aa  47.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  21.93 
 
 
1312 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  28.32 
 
 
1428 aa  47.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  47.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  21.93 
 
 
1305 aa  48.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  21.93 
 
 
1291 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  22.22 
 
 
1259 aa  48.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1462  hypothetical protein  26.06 
 
 
1273 aa  48.1  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197368  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  22.32 
 
 
1259 aa  48.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  22.32 
 
 
1259 aa  47.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.28 
 
 
1375 aa  47  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  23.46 
 
 
1448 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4219  protein of unknown function DUF490  27.89 
 
 
1846 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4258  protein of unknown function DUF490  27.89 
 
 
1846 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.013451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  23.84 
 
 
1372 aa  46.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  23.84 
 
 
1372 aa  46.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>