149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2466 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  100 
 
 
725 aa  1476    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  39.59 
 
 
757 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  39.86 
 
 
743 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  40.09 
 
 
678 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  39.54 
 
 
727 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  37.36 
 
 
712 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  39.36 
 
 
751 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  36.16 
 
 
734 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  33.33 
 
 
772 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  33 
 
 
884 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  36.23 
 
 
800 aa  332  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  36.35 
 
 
911 aa  326  8.000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  25.72 
 
 
847 aa  171  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  26.25 
 
 
896 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  33.13 
 
 
512 aa  79.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  24.82 
 
 
526 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  46.43 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  36.17 
 
 
559 aa  73.6  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  25.55 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  26.01 
 
 
533 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  36.13 
 
 
497 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  30.54 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  37.5 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  40.7 
 
 
525 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  27.6 
 
 
525 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  34.67 
 
 
536 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  34.67 
 
 
535 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  33.65 
 
 
552 aa  63.9  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  28.97 
 
 
512 aa  62.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  33.33 
 
 
472 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  40.66 
 
 
481 aa  60.8  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  38.1 
 
 
454 aa  60.8  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  38.71 
 
 
468 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  22.34 
 
 
575 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  26.78 
 
 
503 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.38 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  33.09 
 
 
468 aa  59.3  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  25.62 
 
 
552 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  39.22 
 
 
544 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  34.46 
 
 
481 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  34.23 
 
 
555 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  36.36 
 
 
472 aa  58.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  28.97 
 
 
458 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  31.58 
 
 
466 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  25.4 
 
 
598 aa  57.4  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  37.63 
 
 
468 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  39.13 
 
 
468 aa  57.4  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  38.04 
 
 
468 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  37.61 
 
 
513 aa  57.4  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  38.04 
 
 
468 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  36.56 
 
 
469 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  24.24 
 
 
547 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  35.83 
 
 
471 aa  55.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  25.6 
 
 
468 aa  55.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  30.94 
 
 
523 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.45 
 
 
549 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  39.76 
 
 
460 aa  54.7  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  36.56 
 
 
468 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  23.8 
 
 
556 aa  54.3  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  22.74 
 
 
529 aa  54.3  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  23.1 
 
 
555 aa  54.3  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  28.76 
 
 
563 aa  53.9  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  36.56 
 
 
468 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  31.21 
 
 
469 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  37.36 
 
 
467 aa  53.5  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  37.63 
 
 
477 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  32.11 
 
 
416 aa  53.1  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5218  leucyl aminopeptidase  33.96 
 
 
417 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  30.19 
 
 
578 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  33.02 
 
 
417 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5067  leucyl aminopeptidase  33.02 
 
 
417 aa  52.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  27.8 
 
 
548 aa  52.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  28.99 
 
 
524 aa  52.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  33.33 
 
 
463 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  21.9 
 
 
548 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  24.67 
 
 
539 aa  51.6  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  34.65 
 
 
506 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  33.02 
 
 
417 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  34.31 
 
 
487 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  33.02 
 
 
417 aa  51.6  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4460  aminopeptidase  28.03 
 
 
794 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000347887  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  23.53 
 
 
550 aa  51.2  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  28.81 
 
 
546 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  22.22 
 
 
549 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  31.13 
 
 
417 aa  50.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  33.05 
 
 
552 aa  50.8  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  38.04 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  33.02 
 
 
408 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  33.02 
 
 
408 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  33.02 
 
 
408 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  29.87 
 
 
501 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  29.87 
 
 
501 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  33.02 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  33.02 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  33.02 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  29.87 
 
 
501 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  33.02 
 
 
384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.73 
 
 
341 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  33.05 
 
 
552 aa  50.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  32.08 
 
 
483 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>