80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0457 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0457  porin, LamB type  100 
 
 		 531 aa  1102    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.467074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5152  porin LamB type  38.21 
 
 		 416 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.430452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3137  maltoporin  33.33 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.0102829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0381  maltoporin  33.97 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3911  maltoporin  33.97 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.714195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0309  maltoporin  33.97 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.288969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6198  porin LamB type  31.19 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0268727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4469  maltoporin  31.24 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.46123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4488  maltoporin  31.38 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4625  maltoporin  31.38 
 
 		 452 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.121289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4573  maltoporin  31.15 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.254819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4574  maltoporin  31.15 
 
 		 452 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0364773 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4423  maltoporin  31.15 
 
 		 452 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0241  maltoporin  31.29 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0254  maltoporin  32.55 
 
 		 456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5517  maltoporin  30.61 
 
 		 446 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03908  maltoporin precursor  30.61 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4498  maltoporin  30.61 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3959  porin LamB type  30.61 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3993  maltoporin  30.61 
 
 		 446 aa  160  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.571058 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03868  hypothetical protein  30.61 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4276  maltoporin  30.61 
 
 		 446 aa  160  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4588  maltoporin  30.61 
 
 		 446 aa  160  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4285  porin LamB type  31.86 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1154  porin, LamB type  29.68 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193768  normal  0.463073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50210  LamB type porin  30.66 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.250171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51390  LamB type porin  29.9 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22010  LamB type porin  28.96 
 
 		 380 aa  144  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4263  porin LamB type  29.54 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4132  porin, LamB type  30.9 
 
 		 463 aa  143  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27200  LamB type porin  29.9 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178962  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26940  LamB type porin  29.58 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16650  LamB type porin  29.44 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50270  LamB type porin  29.51 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0975  maltoporin  28.85 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3756  porin LamB type  27.63 
 
 		 538 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0380817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0920  maltoporin  28.85 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3356  maltoporin  28.85 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33610  LamB type porin  28.89 
 
 		 407 aa  127  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2020  porin, LamB type  29.3 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0033188  normal  0.185389 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09190  LamB type porin  27.82 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0328705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001084  maltoporin  28.71 
 
 		 423 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.62709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2906  sucrose porin ScrY  26.78 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00076782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3593  porin LamB type  26.13 
 
 		 539 aa  117  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0350  porin LamB type  27.87 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0394  porin LamB type  27.05 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215814  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0213  maltoporin  28.44 
 
 		 416 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00663461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04821  maltoporin  27.31 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1282  maltoporin  29.06 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51510  sucrose porin  25.84 
 
 		 535 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000601  maltoporin  26.28 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00907071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1323  maltoporin  24.66 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2955  maltoporin  24.83 
 
 		 435 aa  87.4  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0890  sucrose porin precursor  25.4 
 
 		 540 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3690  maltoporin precursor  28.89 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0257  porin, LamB type  24.12 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0763  porin, LamB type  25.17 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00125923  normal  0.916374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51790  sucrose porin  25.69 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3435  porin LamB type  24.09 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0966151  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1821  putative maltoporin  24.07 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2105  putative maltoporin  24.01 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.301881  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06946  hypothetical protein  23.43 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0709  maltoporin precursor (outer membrane protein S)  23.1 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0034  putative maltoporin  22.22 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3843  normal  0.238888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1736  glucoside specific outer membrane porin BglH-like protein  22.52 
 
 		 557 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0760  porin LamB type  22.48 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.44731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1706  porin LamB type  21.79 
 
 		 532 aa  55.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.973394  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0553  maltoporin  32.5 
 
 		 450 aa  54.3  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1636  glucoside specific outer membrane porin BglH  22.56 
 
 		 557 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2740  porin LamB type  21.88 
 
 		 518 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1781  maltoporin precursor  33.58 
 
 		 395 aa  51.2  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05328  porin transmembrane protein  25.3 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3542  hypothetical protein  26.53 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4229  glucoside specific outer membrane porin BglH  22.06 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03604  carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic  21.71 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03548  hypothetical protein  21.71 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1669  porin LamB type  22.42 
 
 		 532 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4247  porin LamB type  21.2 
 
 		 538 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3934  glucoside specific outer membrane porin BglH  21.2 
 
 		 538 aa  47  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.551157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4274  porin LamB type  21.2 
 
 		 538 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>