More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4749 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  83.77 
 
 		 320 aa  447  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  83.59 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  67.04 
 
 		 281 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  68.75 
 
 		 282 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  68.27 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  68.27 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  67.87 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4910  GntR domain protein  65.74 
 
 		 279 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3833  GntR domain protein  65.74 
 
 		 279 aa  344  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4603  GntR family transcriptional regulator  64.92 
 
 		 278 aa  311  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000349921  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 282 aa  262  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0142  GntR domain protein  50.2 
 
 		 278 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0427  GntR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4268  GntR domain-containing protein  49.59 
 
 		 264 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000808968  hitchhiker  0.000533508 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1580  GntR domain protein  43.33 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4265  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0660  regulatory protein GntR, HTH  40.91 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.519359  normal  0.0398641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0620  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 254 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0506786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0666  regulatory protein GntR HTH  40.5 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3213  regulatory protein GntR HTH  38.24 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0763  GntR domain-containing protein  39.52 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  32.92 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  39.15 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  40.32 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.17 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.35 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  30.4 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 218 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  30.08 
 
 		 241 aa  92.8  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  31.62 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.88 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  31.62 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  27.78 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.91 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1778  GntR domain-containing protein  33.97 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.393282  normal  0.0406668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.56 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  28.51 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.56 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.72 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.3 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.43 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  31.12 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  28.14 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  28.97 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  29.84 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.78 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.06 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3206  regulatory protein GntR, HTH  28.75 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  28.07 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  30.89 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  25.51 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  25.54 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 233 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3597  GntR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1676  regulatory protein GntR HTH  36.27 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  31.53 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3635  regulatory protein GntR, HTH  32.57 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356922  normal  0.468942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  29.87 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  40.62 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  29.41 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  33.16 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  27.39 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  27.39 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 366 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.26 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  29.19 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>