More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0139 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0139  GAF modulated transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 506 aa  1045    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  30.47 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46360  putative two-component response regulator  38.76 
 
 		 210 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3840  transcriptional regulator, LuxR family  36.29 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3043  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 225 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652561  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  50.79 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3950  LuxR family DNA-binding response regulator  36.09 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  38.04 
 
 		 119 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1549  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  44.3 
 
 		 916 aa  63.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 226 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.24 
 
 		 208 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 231 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 217 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03368  predicted DNA-binding response regulator in two-component regulatory system  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000358261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0193  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 254 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0897  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 206 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.18 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  45.33 
 
 		 970 aa  62.4  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  44 
 
 		 234 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03321  hypothetical protein  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00023179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  50.82 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3925  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.237516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4008  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3723  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  50.72 
 
 		 223 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0197  two component LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000437068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3824  LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 200 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.21 
 
 		 215 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 216 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  39.24 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25020  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.34 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 254 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  62  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  52.17 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4168  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 251 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 209 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 937 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.38 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4883  transcriptional regulator, LuxR family  44.74 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1390  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2232  two component transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.501029  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  52.17 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02209  transcriptional regulator AhyR/AsaR family  50.82 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0933251  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1151  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1222  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  50 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  50 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1152  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.17 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  59.32 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32780  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.53 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  42.7 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>