136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1549 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  43.03 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  31.06 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  28.24 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  25.17 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  27.38 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  31.33 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  29.55 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.68 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  27.07 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.43 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.43 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  30.43 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  28.24 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  34.31 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  30.61 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  26 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  28.87 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  30.71 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.81 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  30.95 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  28.35 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  27.84 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  28.06 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  29.06 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.59 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  28.57 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1529  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  28.21 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  28.16 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  28.25 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  28.7 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0971  MscS mechanosensitive ion channel  26.02 
 
 		 272 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0975842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0105  hypothetical protein  42.11 
 
 		 61 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1093  MscS Mechanosensitive ion channel  23.42 
 
 		 389 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.464677  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0803  small mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 342 aa  52  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  29.86 
 
 		 276 aa  51.2  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6682  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 293 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2393  MscS Mechanosensitive ion channel  25.75 
 
 		 408 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 282 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 472 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  25.7 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.73 
 
 		 281 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  26.11 
 
 		 360 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04171  small mechanosensitive ion channel, MscS family protein  25.22 
 
 		 370 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.610357 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.16 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 362 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  31.63 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  30.91 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  25.71 
 
 		 288 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  26.62 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  27.19 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2355  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 295 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0549147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  23.84 
 
 		 288 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 299 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1633  hypothetical protein  26.75 
 
 		 364 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246622  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00392  hypothetical protein  29.91 
 
 		 377 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.65965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02189  hypothetical protein  26.88 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  29.08 
 
 		 373 aa  45.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  25.93 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  23.57 
 
 		 359 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2696  MscS Mechanosensitive ion channel  25.55 
 
 		 369 aa  45.1  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  27.27 
 
 		 284 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 370 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 		 294 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 275 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0426  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000444789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00500  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3360  hypothetical protein  27.08 
 
 		 374 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  24.07 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0015  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  26.06 
 
 		 273 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  25.61 
 
 		 327 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2398  MscS mechanosensitive ion channel  27.08 
 
 		 374 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  30.72 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.14 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1066  MscS Mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 261 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1557  mechanosensitive ion channel family protein  28.97 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.172425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0104  mechanosensitive ion channel family protein  25.2 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  24.41 
 
 		 298 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  24.71 
 
 		 277 aa  42.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  28.29 
 
 		 278 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 324 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>