154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0739 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0739  type IV pilus assembly protein PilM  100 
 
 		 354 aa  711    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2755  type IV pilus assembly protein PilM  39.6 
 
 		 355 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0247  Type IV pilus assembly protein PilM  39.13 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.291692  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0781  type IV pilus assembly protein PilM  39.31 
 
 		 359 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0826  type IV pilus assembly protein PilM  39.72 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5581  type IV pilus assembly protein PilM  38.26 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0202  Type IV pilus assembly protein PilM  40.29 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.466889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3023  type IV pilus assembly protein PilM  37.39 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2461  type IV pilus assembly protein PilM  38.04 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0672  type IV pilus assembly protein PilM  37.86 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0834  type IV pilus assembly protein PilM  39.48 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0210  Type IV pilus assembly protein PilM  38.4 
 
 		 361 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0996  type IV pilus assembly protein PilM  37.97 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0730  type IV pilus assembly protein PilM  38.51 
 
 		 356 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1140  type IV pilus assembly protein PilM  36.52 
 
 		 359 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267286  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0699  type IV pilus assembly protein PilM  38.22 
 
 		 356 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2919  type IV pilus assembly protein PilM  37.5 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0325  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  36.63 
 
 		 380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3240  type IV pilus assembly protein PilM  39.36 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0275  type IV pilus assembly protein PilM  36.44 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.309267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0022  type IV pilus assembly protein PilM  35.73 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.738489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2691  response regulator receiver domain-containing protein  37.03 
 
 		 355 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540139  hitchhiker  0.00311169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45300  Type IV pilus assembly protein  36.6 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3113  fimbrial assembly protein  35.94 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.401806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3407  type IV pilus assembly protein PilM  36.63 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0209183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66660  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  37.14 
 
 		 354 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0542  type IV pilus assembly protein PilM  37.32 
 
 		 354 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5781  type 4 fimbrial biogenesis protein PilM  37.14 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2173  type IV pilus assembly protein PilM  35.94 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.227783  normal  0.447657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1883  type IV pilus assembly protein  36.26 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.685272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0958  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  33.43 
 
 		 354 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0989  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  33.43 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0405  Type IV pilus assembly protein PilM  37.9 
 
 		 354 aa  196  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417469  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0403  Type IV pilus assembly protein PilM  36.44 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5132  type IV pilus biogenesis protein PilM  36.44 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.569259  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1789  type IV pilus assembly protein PilM  34.69 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.739852  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1860  fimbrial assembly membrane protein  34.4 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.151761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02355  fimbrial assembly membrane protein  36.79 
 
 		 318 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.813602  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1937  type IV pilus assembly protein PilM  34.46 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  32.86 
 
 		 352 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2032  type IV pilus biogenesis protein PilM  30.99 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  31.82 
 
 		 351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  31.16 
 
 		 352 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  30.68 
 
 		 354 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0233  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0335  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1469  type IV pilus assembly protein PilM  31.01 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11937  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0608  type IV pilus assembly protein PilM  33.33 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  30.86 
 
 		 351 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4270  type IV pilus assembly protein PilM  29.21 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3899  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00788991  normal  0.338087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  30.17 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  29.4 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4008  type IV pilus assembly protein PilM  29.43 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0281  type IV pilus biogenesis protein PilM  30.03 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3703  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.288222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0242  type IV pilus assembly protein PilM  30.03 
 
 		 359 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0370  type IV pilus assembly protein PilM  30.29 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.519151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  29.48 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4089  type IV pilus assembly protein PilM  29.43 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4207  type IV pilus assembly protein PilM  29.43 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  29.89 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3373  type IV pilus biogenesis protein PilM  29.43 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0745498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4118  type IV pilus assembly protein PilM  28.57 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3711  type IV pilus assembly protein PilM  29.75 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.480813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0208  type IV pilus assembly protein PilM  28.9 
 
 		 359 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0256  type IV pilus assembly protein PilM  28.16 
 
 		 359 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1640  type IV pilus assembly protein PilM  31.05 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0248  type IV pilus assembly protein PilM  29.97 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00515  putative Type IV pilus biogenesis protein PilM  27.22 
 
 		 355 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0333  type IV pilus assembly protein PilM  26.4 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.872889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0537  type IV pilus assembly protein PilM  27.79 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.539462  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0671  type IV pilus assembly protein PilM  27.47 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0158  type IV pilus assembly protein PilM  26 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0467  type IV pilus biogenesis protein PilM  25.78 
 
 		 359 aa  129  9.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2906  type IV pilus assembly protein PilM  27.51 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0321305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3253  type IV pilus assembly protein PilM  27.22 
 
 		 361 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2975  fimbrial type-4 assembly protein  26.93 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.28529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1762  type IV pilus assembly protein PilM  27.15 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.35494  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3272  type IV pilus assembly protein PilM  28.45 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0396  Tfp pilus assembly protein ATPase PilM-like protein  27.59 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917562 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0322  type IV pilus assembly protein PilM  26.46 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2203  type IV pilus assembly protein PilM  27.85 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1313  type IV pilus assembly protein PilM  27.3 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.269732  decreased coverage  0.00550758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3135  Type IV pilus assembly protein PilM  27.3 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3686  Type IV pilus assembly protein PilM  26.17 
 
 		 369 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1465  type IV pilus assembly protein PilM  27.61 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00540652  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1725  type IV pilus assembly protein PilM  25.53 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2453  type IV pilus assembly protein PilM  26.94 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237184  hitchhiker  0.0000000165118 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4173  type IV pilus assembly protein PilM  25.5 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4212  type IV pilus assembly protein PilM  25.5 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.175207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2739  type IV pilus assembly protein PilM  27.35 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1984  type IV pilus assembly protein PilM  25.14 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0434865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06050  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  24.47 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1037  type IV pilus assembly protein PilM  26.89 
 
 		 348 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1830  type IV pilus assembly protein PilM  25.35 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0258246  normal  0.367696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0383  type IV pili biogenesis protein PilM  30.49 
 
 		 282 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17820  type IV pilus assembly protein PilM  25.85 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.61643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1605  type IV pilus assembly protein PilM  22.78 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>