More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11541 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  90.06 
 
 		 523 aa  950    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  98.28 
 
 		 523 aa  1021    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1040    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  76.48 
 
 		 523 aa  825    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  54.07 
 
 		 525 aa  557  1e-157  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  51.92 
 
 		 534 aa  554  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  46.68 
 
 		 535 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  55.08 
 
 		 525 aa  537  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  49.69 
 
 		 491 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  45.79 
 
 		 516 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  33.27 
 
 		 533 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 		 541 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 551 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 		 539 aa  259  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 551 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 		 551 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 543 aa  236  9e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 501 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 534 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.76 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.4 
 
 		 524 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  22.83 
 
 		 528 aa  128  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  31.72 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 528 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.38 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.18 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  25.12 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  25.1 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 526 aa  107  7e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0183  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  23.08 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  22.44 
 
 		 505 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 544 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  22.87 
 
 		 495 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  22.72 
 
 		 519 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0468  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 		 528 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.2 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4250  peptide ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.12 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.146199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 521 aa  99.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 520 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  22.77 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  22.77 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  22.77 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  23.71 
 
 		 517 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  22.77 
 
 		 512 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  22.77 
 
 		 512 aa  98.6  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7516  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.52 
 
 		 565 aa  97.8  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.31 
 
 		 512 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.36 
 
 		 565 aa  97.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 525 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2650  acetate kinase  22.94 
 
 		 541 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.76691 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.11 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.11 
 
 		 512 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.11 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2484  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0213722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  22.11 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.13 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  22.11 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  22.11 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7214  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.11 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2739  extracellular solute-binding protein family 5  21.89 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.941667  normal  0.188577 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  24.84 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 		 513 aa  94.7  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 551 aa  94.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  23.94 
 
 		 537 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  22.45 
 
 		 523 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  23.52 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  22.78 
 
 		 532 aa  94  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  21.45 
 
 		 532 aa  94  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.14 
 
 		 535 aa  93.6  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  23.31 
 
 		 537 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 525 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  23.31 
 
 		 537 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  26.48 
 
 		 544 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  23.39 
 
 		 520 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  23.86 
 
 		 535 aa  92.8  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  22.75 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1500  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 		 541 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 531 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  23.31 
 
 		 537 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0459  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 504 aa  92  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  23.12 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 501 aa  92  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>