More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4159 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  96.64 
 
 
387 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4159  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
387 aa  722    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.297695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4133  major facilitator superfamily MFS_1  99.17 
 
 
363 aa  669    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.308259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0558  major facilitator transporter  74.61 
 
 
384 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257784  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  51.1 
 
 
397 aa  311  2e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  39.53 
 
 
400 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0303  major facilitator transporter  32.61 
 
 
402 aa  193  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.421003  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  31.73 
 
 
407 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1520  major facilitator transporter  33.92 
 
 
412 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
424 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1734  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156711  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0897  MFS drug efflux pump  33.04 
 
 
381 aa  179  7e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  34.99 
 
 
393 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1661  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 
414 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0192814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  34.62 
 
 
417 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  33.24 
 
 
417 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  33.24 
 
 
417 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.200396 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  32.97 
 
 
417 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  31.01 
 
 
425 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  32.61 
 
 
421 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  33.98 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  32.39 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  30.66 
 
 
414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
410 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  30.73 
 
 
414 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
404 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
422 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  32.31 
 
 
438 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 
412 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  32.31 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  32.22 
 
 
404 aa  166  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
438 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
438 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  29.61 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0857  major facilitator superfamily MFS_1  37.01 
 
 
403 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68930  putative permease  34.93 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.770778  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5519  major facilitator transporter  33.51 
 
 
398 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.752642  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5883  major facilitator transporter  33.51 
 
 
398 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 
499 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  38.32 
 
 
384 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6392  major facilitator transporter  34.34 
 
 
398 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.319868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1894  major facilitator transporter  34.49 
 
 
395 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 
418 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2537  major facilitator transporter  35.15 
 
 
395 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128789  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  32.5 
 
 
433 aa  159  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 
422 aa  159  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
407 aa  159  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 
405 aa  159  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  32.87 
 
 
417 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  32.87 
 
 
417 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3069  putative transporter transmembrane protein  34.97 
 
 
428 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.517563  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1382  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
438 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101232  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  30.51 
 
 
409 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3002  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
448 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.571362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  28.73 
 
 
424 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  32.87 
 
 
417 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  32.87 
 
 
417 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  32.87 
 
 
417 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  29.38 
 
 
402 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  30.75 
 
 
434 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8091  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2295  major facilitator transporter  33.69 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.855468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
440 aa  153  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3349  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 
429 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  31.04 
 
 
422 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4186  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 
408 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513939  normal  0.0375994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1469  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 
377 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
402 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
434 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
404 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1491  major facilitator transporter  32.87 
 
 
409 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  34.52 
 
 
405 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  32.69 
 
 
402 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  30.96 
 
 
405 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.77 
 
 
426 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  35.75 
 
 
526 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  32.21 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  28.91 
 
 
411 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  28.07 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  28.07 
 
 
415 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  28.07 
 
 
415 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1359  major facilitator transporter  36.23 
 
 
400 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0713352  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4723  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
413 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0900603  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  28.07 
 
 
415 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2970  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
408 aa  143  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.588323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
415 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 
425 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4820  major facilitator transporter  32.62 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  29.33 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  34.44 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0747  major facilitator transporter  32.66 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>