More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3544 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  99.51 
 
 
412 aa  786    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  96.36 
 
 
412 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
412 aa  789    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  68.28 
 
 
418 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  35.31 
 
 
542 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  27.88 
 
 
343 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.91 
 
 
354 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  30.11 
 
 
370 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  34.63 
 
 
369 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  29.01 
 
 
368 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  26.59 
 
 
355 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  26.72 
 
 
355 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  26.89 
 
 
355 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  26.89 
 
 
355 aa  106  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  20.94 
 
 
351 aa  106  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 
368 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  27.47 
 
 
357 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
417 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 
436 aa  103  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  26.63 
 
 
341 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  28.5 
 
 
388 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  26.44 
 
 
355 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.23 
 
 
390 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  27.54 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  22.71 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  32.81 
 
 
423 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  30.3 
 
 
343 aa  96.7  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  31.05 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  33.64 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  28.12 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  23.92 
 
 
351 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  36.47 
 
 
390 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 
361 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  31.73 
 
 
376 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  31.73 
 
 
376 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  26.5 
 
 
356 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  33.15 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.73 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  25.68 
 
 
340 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  32.77 
 
 
487 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  36.63 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  27.3 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  33.69 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  31.05 
 
 
425 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  29.82 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 
392 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.91 
 
 
361 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  30.22 
 
 
423 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  35.27 
 
 
381 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  27.72 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  35.27 
 
 
381 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3372  sporulation integral membrane protein YtvI  25.47 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  23.78 
 
 
363 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  28.07 
 
 
345 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.01 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  22.95 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  24.18 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  32.8 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  23.77 
 
 
386 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  23.5 
 
 
361 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  33.74 
 
 
439 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  23.5 
 
 
361 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  34.82 
 
 
381 aa  87  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  35.92 
 
 
464 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  24.07 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  24.36 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  25.29 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  23.78 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  24.49 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  23.78 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  23.78 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  23.21 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1098  protein of unknown function UPF0118  36.57 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370016  normal  0.531721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  27.5 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.68 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  36.13 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  27.68 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  27.59 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29.96 
 
 
369 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  24.93 
 
 
352 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2979  hypothetical protein  28.53 
 
 
387 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  31.6 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  22.82 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  23.1 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  26.79 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  32.21 
 
 
420 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3538  hypothetical protein  23.74 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.25155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  30.81 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.14 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>