More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1706 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1706  NusB antitermination factor  100 
 
 		 138 aa  273  6e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17920  NusB antitermination factor  72.99 
 
 		 138 aa  204  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1839  NusB antitermination factor  72.26 
 
 		 138 aa  201  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  66.18 
 
 		 138 aa  189  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2032  NusB antitermination factor  65.15 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2269  NusB antitermination factor  63.5 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190221  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2006  NusB antitermination factor  61.31 
 
 		 136 aa  168  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000909018 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  61.48 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  63.57 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12640  NusB antitermination factor  56.93 
 
 		 137 aa  160  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0537288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2854  transcription antitermination factor NusB  57.25 
 
 		 136 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026824  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2418  transcription antitermination factor NusB  57.35 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2942  NusB antitermination factor  58.09 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000122519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1391  NusB antitermination factor  55.56 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.243809  normal  0.057141 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3008  NusB antitermination factor  58.87 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  51.77 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3147  NusB antitermination factor  53.44 
 
 		 135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.511001  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0083  transcription termination factor  52.67 
 
 		 190 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  55.91 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2394  NusB antitermination factor  53.24 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1843  NusB antitermination factor  54.48 
 
 		 136 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1094  transcription antitermination protein NusB  52.94 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1850  transcription antitermination factor NusB  55.22 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2359  transcription antitermination protein NusB  48.18 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.600142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2400  transcription antitermination protein NusB  48.18 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.199761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2406  transcription antitermination protein NusB  48.18 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798177  normal  0.0506261 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0919  transcription antitermination factor NusB  45.93 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  47.52 
 
 		 163 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1304  NusB antitermination factor  51.94 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.592114  normal  0.0232631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  48.2 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3751  transcription antitermination protein NusB  47.1 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0880  NusB antitermination factor  51.61 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  45.99 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3205  NusB antitermination factor  59.38 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  44.93 
 
 		 163 aa  110  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14710  transcription antitermination factor NusB  43.07 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.655877  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1703  NusB antitermination factor  52.58 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.747293  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3146  NusB antitermination factor  42.96 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121302 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0470  NusB antitermination factor  44.96 
 
 		 167 aa  103  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.246877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3504  NusB antitermination factor  38.81 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1020  NusB antitermination factor  38.28 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000376334  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05250  transcription antitermination factor NusB  43.31 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.615049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0834  NusB antitermination factor  36.09 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000205834  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1001  NusB antitermination factor  45.35 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000103946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2539  NusB antitermination factor  40.15 
 
 		 195 aa  93.6  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  36.3 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1642  NusB antitermination factor  42.64 
 
 		 153 aa  92  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1215  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  45.45 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0522  NusB antitermination factor  37.12 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.518761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  34.27 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1449  transcription antitermination factor NusB  40.71 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1382  NusB antitermination factor  36.96 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  35.88 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1905  NusB antitermination factor  35.66 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1534  transcription antitermination protein NusB  35.66 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.276167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2598  NusB antitermination factor  30.3 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.292091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08000  transcription antitermination factor NusB  40.91 
 
 		 183 aa  87.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000357479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  34.81 
 
 		 138 aa  87.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1228  NusB antitermination factor  32.82 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1693  transcription antitermination protein NusB  36.57 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0564  hypothetical protein  32.03 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000187667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0246  transcription antitermination protein NusB  38.58 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1457  NusB antitermination factor  37.59 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0617192  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1702  NusB antitermination factor  40.7 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  30.6 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  42.53 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3091  NusB antitermination factor  43.02 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  39.78 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  29.85 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2325  transcription antitermination protein NusB  34.88 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000736737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1230  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1059  transcription antitermination protein NusB  34.78 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1061  transcription antitermination factor NusB  33.59 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000379385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2727  NusB antitermination factor  39.53 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3020  NusB antitermination factor  33.33 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.532849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  44.94 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1053  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  30.77 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1069  NusB antitermination factor  29.77 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269454  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  30.83 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0164  NusB antitermination factor  31.3 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1278  N utilization substance protein B  31.25 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.279513  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1089  NusB antitermination factor  32.03 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.441067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2830  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0145632  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2922  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  35.71 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2738  NusB antitermination factor  37.31 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0276393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1185  transcription antitermination protein NusB  38.04 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0066267  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  29.77 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1708  NusB antitermination factor  35.48 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1622  NusB antitermination factor  38.04 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  30.47 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0283  NusB antitermination factor  31.78 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.102265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1780  NusB antitermination factor  40.7 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97176  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1452  transcription antitermination protein NusB  35.16 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2515  NusB antitermination factor  44.44 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.797905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  40.24 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>