More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1633 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1633  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 594 aa  1170    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.364457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2318  3-dehydroquinate synthase  57.05 
 
 		 615 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0070259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  53.98 
 
 		 593 aa  580  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  57.22 
 
 		 579 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  57.24 
 
 		 604 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  57.14 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0403  3-dehydroquinate synthase  48.47 
 
 		 591 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.831997 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1467  3-dehydroquinate synthase  46.6 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7572  3-dehydroquinate synthase  64.74 
 
 		 382 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.498964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1717  3-dehydroquinate synthase  62.3 
 
 		 372 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3065  3-dehydroquinate synthase  60.99 
 
 		 375 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.497615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0504  3-dehydroquinate synthase  62.36 
 
 		 381 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0533  3-dehydroquinate synthase  63.01 
 
 		 382 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.630888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1131  3-dehydroquinate synthase  63.56 
 
 		 370 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.547485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0491  3-dehydroquinate synthase  64.38 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2564  3-dehydroquinate synthase  59.39 
 
 		 380 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.443147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2169  3-dehydroquinate synthase  63.29 
 
 		 371 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0536  3-dehydroquinate synthase  62.36 
 
 		 382 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0293  3-dehydroquinate synthase  61.64 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.448053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0396  3-dehydroquinate synthase  61.5 
 
 		 383 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1283  3-dehydroquinate synthase  59.34 
 
 		 367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.637861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3888  3-dehydroquinate synthase  58.95 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114459  decreased coverage  0.00292677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1432  3-dehydroquinate synthase  59.73 
 
 		 373 aa  405  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68619  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3595  3-dehydroquinate synthase  58.68 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0910  3-dehydroquinate synthase  59.89 
 
 		 378 aa  401  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2818  3-dehydroquinate synthase  58.47 
 
 		 370 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1478  3-dehydroquinate synthase  58.47 
 
 		 370 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.389848  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1608  3-dehydroquinate synthase  59 
 
 		 383 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.511347 
 
 
-
 
NC_004310  BR2028  3-dehydroquinate synthase  60.33 
 
 		 378 aa  395  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.583475  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1950  3-dehydroquinate synthase  60.33 
 
 		 378 aa  395  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2487  3-dehydroquinate synthase  58.4 
 
 		 370 aa  395  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.0143197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1528  3-dehydroquinate synthase  58.2 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0261057  normal  0.35523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4051  3-dehydroquinate synthase  58.56 
 
 		 381 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0037  3-dehydroquinate synthase  54.89 
 
 		 377 aa  385  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0680  3-dehydroquinate synthase  60.11 
 
 		 379 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1899  3-dehydroquinate synthase  54.52 
 
 		 369 aa  355  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0721  3-dehydroquinate synthase  54.4 
 
 		 369 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.879879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3741  3-dehydroquinate synthase  54.1 
 
 		 385 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0007  3-dehydroquinate synthase  53.59 
 
 		 369 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1800  3-dehydroquinate synthase  53.17 
 
 		 368 aa  333  6e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36.28 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2274  3-dehydroquinate synthase  49.87 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.492898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  47.67 
 
 		 361 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 365 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  48.75 
 
 		 367 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  47.37 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 376 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 365 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 364 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  48.31 
 
 		 364 aa  287  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 365 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  48.48 
 
 		 366 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  47.51 
 
 		 359 aa  282  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  44.17 
 
 		 358 aa  280  6e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  48.04 
 
 		 367 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  45.83 
 
 		 368 aa  276  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  43.78 
 
 		 431 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  45.56 
 
 		 368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4386  3-dehydroquinate synthase  44.2 
 
 		 363 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  45.48 
 
 		 369 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  48.9 
 
 		 367 aa  273  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  273  9e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  46.17 
 
 		 368 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  44.81 
 
 		 365 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  45.63 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  46.07 
 
 		 374 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  46.99 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  46.96 
 
 		 359 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0735  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 367 aa  270  8e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.116609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0704  3-dehydroquinate synthase  45.74 
 
 		 367 aa  270  8e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  46.26 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4183  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 366 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4222  3-dehydroquinate synthase  40.17 
 
 		 366 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  43.8 
 
 		 368 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  43.59 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  43.92 
 
 		 370 aa  266  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1021  3-dehydroquinate synthase  41.6 
 
 		 359 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  43.47 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5179  3-dehydroquinate synthase  41.46 
 
 		 364 aa  265  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.981519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  45.69 
 
 		 368 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5008  3-dehydroquinate synthase  41.8 
 
 		 363 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  42.82 
 
 		 355 aa  264  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  46.7 
 
 		 359 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  43.96 
 
 		 362 aa  262  1e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2257  3-dehydroquinate synthase  45.21 
 
 		 354 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1758  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3757  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3699  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00532697  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2746  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2796  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  43.09 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3207  3-dehydroquinate synthase  45.3 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0892348  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  43.3 
 
 		 359 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2027  3-dehydroquinate synthase  45.58 
 
 		 359 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  42.9 
 
 		 359 aa  260  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5301  3-dehydroquinate synthase  40 
 
 		 367 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  44.69 
 
 		 359 aa  259  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>