286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0667 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0667  amino acid permease-associated region  100 
 
 
474 aa  949  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.819834  decreased coverage  0.000117019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1795  amino acid permease-associated region  70.25 
 
 
516 aa  688  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0208  amino acid permease-associated region  63 
 
 
510 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.350417  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0188  amino acid permease-associated region  63 
 
 
510 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1244  amino acid permease-associated region  62.58 
 
 
513 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.42825e-07  decreased coverage  2.88489e-06 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0199  amino acid permease-associated region  63 
 
 
510 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5564  amino acid permease-associated region  62.58 
 
 
510 aa  592  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293737  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0605  amino acid permease-associated region  45.57 
 
 
504 aa  418  1e-115  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.912711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2078  amino acid permease-associated region  46.69 
 
 
527 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.491472  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1999  amino acid permease-associated region  34.47 
 
 
483 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.597442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0436  amino acid permease-associated region  32.57 
 
 
467 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6713  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
479 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6478  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
479 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1922  amino acid permease-associated region  36.03 
 
 
485 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.255466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2557  amino acid permease-associated region  31.92 
 
 
484 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.058591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3239  amino acid permease-associated region  34.01 
 
 
464 aa  215  1e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4433  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 
484 aa  215  1e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  4.91134e-07  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0252  amino acid permease-associated region  34.18 
 
 
485 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1105  amino acid permease-associated region  34.06 
 
 
516 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.536968  normal  0.272162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7499  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 
495 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1170  amino acid permease family protein  33.93 
 
 
497 aa  201  2e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1630  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 
497 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1037  amino acid permease-associated region  32.93 
 
 
509 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.809227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1046  amino acid permease-associated region  29.93 
 
 
492 aa  186  1e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2722  amino acid permease-associated region  32.4 
 
 
486 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3507  amino acid permease-associated region  31.14 
 
 
491 aa  177  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3067  amino acid permease-associated region  33.49 
 
 
498 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4735  amino acid permease-associated region  28.97 
 
 
488 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0673378  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3953  amino acid permease-associated region  28.17 
 
 
485 aa  176  1e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0153  amino acid permease-associated region  31.3 
 
 
487 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00320  amino acid transporter  32.72 
 
 
483 aa  170  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0955  amino acid transporter  27.29 
 
 
481 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3754  amino acid permease-associated region  28.98 
 
 
485 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3579  amino acid permease-associated region  32.04 
 
 
496 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0767  amino acid permease-associated region  28.91 
 
 
490 aa  167  3e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.184256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1747  amino acid permease-associated region  30.51 
 
 
510 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1731  amino acid permease-associated region  30.43 
 
 
509 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.177585  decreased coverage  0.00117638 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0145  amino acid permease-associated region  27.82 
 
 
486 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4853  amino acid permease-associated region  29.5 
 
 
493 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.983882  normal  0.590068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8962  amino acid permease-associated region  29 
 
 
504 aa  135  2e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.354248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3178  amino acid permease-associated region  29.7 
 
 
502 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  9.63226e-06  hitchhiker  9.95055e-10 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2522  amino acid permease-associated region  28.65 
 
 
461 aa  113  1e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4018  amino acid permease-associated region  28.14 
 
 
507 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536093  hitchhiker  0.00116869 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0648  amino acid permease-associated region  24.84 
 
 
469 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2919  amino acid permease-associated region  26.13 
 
 
507 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0553691 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1999  amino acid permease-associated region  25 
 
 
490 aa  85.9  1e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.352019  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0242  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
502 aa  82  2e-14  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.990635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0232  amino acid permease-associated region  25.26 
 
 
511 aa  82  2e-14  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0222  amino acid permease-associated region  24.62 
 
 
502 aa  81.6  3e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0218084  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1683  amino acid permease-associated region  25.08 
 
 
501 aa  80.1  7e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7711  amino acid permease-associated region  27.12 
 
 
482 aa  79.7  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668016  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  29.08 
 
 
441 aa  79  2e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1968  amino acid permease-associated region  24.57 
 
 
495 aa  77.8  4e-13  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.196311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7852  Amino acid transporter-like protein  25.4 
 
 
489 aa  77.8  4e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512635  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2839  amino acid permease-associated region  23.54 
 
 
506 aa  77.4  6e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.703085 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1969  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
487 aa  74.7  3e-12  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0135269  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1778  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 
475 aa  75.1  3e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3068  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 
506 aa  74.7  3e-12  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2831  amino acid permease-associated region  24.72 
 
 
497 aa  74.3  4e-12  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.820669 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1312  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 
450 aa  73.2  9e-12  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2478  amino acid permease-associated region  24.79 
 
 
459 aa  70.5  7e-11  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.65738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10330  amino acid transporter  26.03 
 
 
553 aa  68.6  3e-10  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1035  amino acid permease-associated region  22.67 
 
 
477 aa  64.7  4e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  25.09 
 
 
447 aa  64.3  4e-09  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  23.08 
 
 
468 aa  63.2  1e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  21.86 
 
 
454 aa  62  2e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  23.88 
 
 
440 aa  61.6  3e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3295  amino acid permease-associated region  24.32 
 
 
486 aa  61.2  4e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0524  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 
492 aa  60.5  7e-08  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735838  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0513  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 
492 aa  60.5  7e-08  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.120819  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0502  amino acid permease-associated region  23.57 
 
 
492 aa  60.1  8e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 
473 aa  60.1  9e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 
473 aa  60.1  9e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  24.15 
 
 
451 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 
482 aa  58.5  3e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  40 
 
 
439 aa  58.5  3e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3299  amino acid permease-associated region  23.89 
 
 
491 aa  57.4  5e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388288  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  27.56 
 
 
473 aa  57  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  23.67 
 
 
451 aa  57  7e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  23.86 
 
 
443 aa  56.6  8e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  22.36 
 
 
468 aa  56.6  9e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  21.32 
 
 
460 aa  56.2  1e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  26.85 
 
 
437 aa  55.5  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0094  amino acid permease-associated region  31.01 
 
 
417 aa  55.1  3e-06  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.699923  hitchhiker  0.000401334 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  25.69 
 
 
473 aa  55.1  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 
455 aa  55.1  3e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 
466 aa  54.7  4e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  20.78 
 
 
456 aa  54.3  5e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0042  amino acid permease-associated region  23.37 
 
 
507 aa  54.3  5e-06  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4037  ethanolamine transproter  22.99 
 
 
486 aa  54.3  5e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  21.36 
 
 
462 aa  54.3  5e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0409  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 
526 aa  53.5  7e-06  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4486  ethanolamine permease  24.68 
 
 
467 aa  53.1  1e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  22.81 
 
 
440 aa  52.8  1e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0679  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 
517 aa  52.8  1e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4869  ethanolamine transproter  24.68 
 
 
467 aa  53.1  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.154328  normal  0.109482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4573  ethanolamine transproter  24.68 
 
 
467 aa  53.1  1e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  21.61 
 
 
450 aa  52.4  2e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0321  amino acid permease family protein  22.64 
 
 
460 aa  52  2e-05  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0838341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  25.82 
 
 
489 aa  52  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>