More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3957 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  100 
 
 		 444 aa  915    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  55.53 
 
 		 445 aa  484  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  55.9 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  51.96 
 
 		 444 aa  458  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  55.04 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  53.86 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  52.22 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  52.22 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  50.45 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  51.96 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  45.21 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0428  monooxygenase, FAD-binding  34.68 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00208516  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  34.43 
 
 		 415 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  36.1 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0428  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 410 aa  183  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25324  normal  0.196339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  34.48 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0708  monooxygenase FAD-binding  30.69 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  36.56 
 
 		 417 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0342  tryptophan halogenase  28.54 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0436  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0340  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.131128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  35.56 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0337  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0332  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0340  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1497  tryptophan halogenase  32.05 
 
 		 406 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.756039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0330  monooxygenase FAD-binding  28.86 
 
 		 429 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  32.6 
 
 		 441 aa  163  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4378  FAD-binding protein  33.03 
 
 		 436 aa  162  9e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3686  monooxygenase, FAD-binding protein  30.77 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  31.79 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0331  monooxygenase, FAD-binding  30.77 
 
 		 435 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  29.31 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2822  flavoprotein/dehydrogenase  31.39 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4091  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  32.39 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2103  putative tryptophan halogenase  35.8 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0674783  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1005  FAD binding domain-containing protein  35.8 
 
 		 480 aa  156  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0347975  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5621  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  31.19 
 
 		 409 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3616  tryptophan halogenase  31.71 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.190224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4779  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3702  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2240  alkylhalidase  35.8 
 
 		 480 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345155  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2048  putative tryptophan halogenase  35.8 
 
 		 480 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  32.09 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  32.25 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3389  FAD-binding protein  32.18 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  36.39 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  34.93 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  30.92 
 
 		 506 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004059  FAD-binding protein inferred for ABFAE pathway  29.26 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03920  Monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:Tryptophanhalogenase  28.83 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.117201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3913  monooxygenase FAD-binding  28.97 
 
 		 416 aa  149  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0135  tryptophan halogenase  28.46 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.138396  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  27.69 
 
 		 415 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3046  tryptophan halogenase  31.89 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354433  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2003  tryptophan halogenase  28.42 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.923769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3521  tryptophan halogenase  30.31 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.956189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0945  putative oxidoreductase  30.75 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183705  normal  0.443912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  27.97 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_003296  RS00759  putative oxidoreductase protein  30.59 
 
 		 419 aa  143  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  0.0681702 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 		 647 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2065  tryptophan halogenase  31.42 
 
 		 439 aa  136  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.215345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1615  dehydrogenase  30.28 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5510  tryptophan halogenase  30.75 
 
 		 587 aa  129  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2108  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.478337  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2756  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.471979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3552  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  32.59 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1110  tryptophan halogenase  25.32 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01623  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.282796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.73 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5266  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4728  FAD dependent oxidoreductase  26.45 
 
 		 566 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6189  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 549 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6708  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 566 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 423 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.96 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 398 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1117  PrnC  26.16 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0437  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2735  halogenase PrnC  26.16 
 
 		 566 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6985  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.176502  normal  0.543352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2887  halogenase PrnC  26.16 
 
 		 566 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.939862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 		 445 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0003  halogenase PrnC  25.43 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.567897  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1397  putative halogenase  25.43 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666039  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1482  putative halogenase  25.43 
 
 		 552 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1201  halogenase PrnC  25.43 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14853  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0442  halogenase PrnC  25.72 
 
 		 573 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1135  halogenase PrnC  25.43 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0165  halogenase PrnC  25.43 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.537532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.05 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6353  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 606 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000576963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.35 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  30.49 
 
 		 424 aa  86.3  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>