More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3251 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 430 aa  812    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  70.54 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  66.34 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  67.08 
 
 		 439 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  68.22 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  68.22 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  67.88 
 
 		 422 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 413 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.477353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.55 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  31 
 
 		 414 aa  126  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  33.06 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.96 
 
 		 402 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.59 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.59 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  28.2 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.71 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  27.94 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  27.94 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  27.94 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  30.29 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 418 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  28.05 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.12 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  29.12 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  27.94 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  27.68 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  27.68 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.54 
 
 		 410 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  33.44 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  27.68 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.12 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  29.12 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 405 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  25.07 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  28.88 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.85 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.57 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6515  major facilitator superfamily permease  28.54 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 442 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.1 
 
 		 400 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  26.8 
 
 		 400 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.1 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.79 
 
 		 438 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 410 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 410 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  28.85 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>