175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0142 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 		 637 aa  1328    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  63.38 
 
 		 639 aa  877    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  64.48 
 
 		 639 aa  884    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  64.57 
 
 		 602 aa  823    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.89 
 
 		 834 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.9 
 
 		 639 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.97 
 
 		 636 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.39 
 
 		 636 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.99 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.28 
 
 		 605 aa  336  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.35 
 
 		 821 aa  332  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 		 627 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.82 
 
 		 762 aa  326  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.79 
 
 		 553 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.69 
 
 		 766 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  36.36 
 
 		 776 aa  320  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.04 
 
 		 533 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.49 
 
 		 673 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.02 
 
 		 618 aa  317  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.1 
 
 		 618 aa  316  7e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.18 
 
 		 905 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.91 
 
 		 785 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 		 613 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  37.6 
 
 		 777 aa  310  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.03 
 
 		 673 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.45 
 
 		 542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.18 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  40.69 
 
 		 736 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 		 790 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 		 775 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.84 
 
 		 526 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.07 
 
 		 655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 		 772 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  33.71 
 
 		 795 aa  303  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.11 
 
 		 781 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 		 795 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.83 
 
 		 760 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.1 
 
 		 774 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.77 
 
 		 534 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.06 
 
 		 779 aa  294  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.58 
 
 		 779 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.79 
 
 		 549 aa  290  5.0000000000000004e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.5 
 
 		 529 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.25 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.62 
 
 		 858 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.23 
 
 		 812 aa  286  7e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.03 
 
 		 812 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  37.36 
 
 		 469 aa  283  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.29 
 
 		 634 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.57 
 
 		 765 aa  278  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.64 
 
 		 534 aa  276  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.78 
 
 		 527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.54 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.86 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 547 aa  262  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  30 
 
 		 866 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0553  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.75 
 
 		 857 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.69 
 
 		 614 aa  252  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.23 
 
 		 584 aa  248  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 		 665 aa  248  3e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.79 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.48 
 
 		 852 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  29.34 
 
 		 896 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.01 
 
 		 525 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.13 
 
 		 688 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 		 422 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.97 
 
 		 884 aa  239  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0561  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.96 
 
 		 853 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 		 447 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.2 
 
 		 683 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.33 
 
 		 888 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  32.89 
 
 		 543 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.73 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.11 
 
 		 794 aa  232  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.7 
 
 		 500 aa  233  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.55 
 
 		 515 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1115  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.18 
 
 		 888 aa  230  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0366712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1211  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.51 
 
 		 888 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000482778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.53 
 
 		 863 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1405  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.4 
 
 		 910 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1100  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.92 
 
 		 906 aa  228  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.494393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1396  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.12 
 
 		 913 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1432  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 		 915 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  30.69 
 
 		 889 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1075  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.93 
 
 		 900 aa  226  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.513664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.43 
 
 		 868 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2949  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.98 
 
 		 913 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0525073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.2 
 
 		 489 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1809  beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 		 883 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.34 
 
 		 504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 		 820 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  32.95 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.3 
 
 		 797 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.98 
 
 		 676 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2936  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.61 
 
 		 896 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000338099  normal  0.491372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3018  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.43 
 
 		 896 aa  219  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00614959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.2 
 
 		 628 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.9 
 
 		 533 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1232  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.81 
 
 		 885 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12617  normal  0.176702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>