More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0013 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  100 
 
 
309 aa  598  1e-170  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
325 aa  181  2e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  37.7 
 
 
319 aa  172  9e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  35.29 
 
 
299 aa  160  3e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  36.27 
 
 
317 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  36.53 
 
 
319 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
319 aa  148  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  35.91 
 
 
319 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 
319 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
319 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  35.67 
 
 
344 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  32.9 
 
 
318 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  34.89 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
319 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  33.95 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.35 
 
 
318 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
309 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  30.9 
 
 
429 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  29.59 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  33.87 
 
 
319 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
425 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  31.43 
 
 
319 aa  124  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
311 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
307 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.2 
 
 
303 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  32.1 
 
 
440 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  30.31 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  32.63 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  32.2 
 
 
447 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  28.42 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  31.23 
 
 
425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  30.27 
 
 
293 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  31.07 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  30 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  29.12 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  29.93 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  31.43 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  28.71 
 
 
319 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  28.71 
 
 
319 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  29.84 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  29.18 
 
 
307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  32.19 
 
 
300 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  29.13 
 
 
430 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 
308 aa  109  6e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  31 
 
 
309 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  28.48 
 
 
313 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  28.71 
 
 
306 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  29.08 
 
 
325 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  30.19 
 
 
319 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  31.69 
 
 
312 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  31.25 
 
 
445 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  30.26 
 
 
435 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  27.15 
 
 
293 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  26.67 
 
 
322 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
312 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  30.39 
 
 
305 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  26.06 
 
 
322 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 
292 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  30.45 
 
 
320 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  30 
 
 
346 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  28.21 
 
 
321 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
346 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
314 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  26.67 
 
 
321 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  26.49 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6451  inner-membrane translocator  28.91 
 
 
421 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  28.92 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  27.83 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  27.27 
 
 
322 aa  99.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  27.53 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  27.53 
 
 
323 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  32.34 
 
 
310 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  32.39 
 
 
426 aa  99  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  27.4 
 
 
418 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  26.46 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  27.63 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  26.65 
 
 
323 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  32.39 
 
 
426 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  27.83 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  29.05 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  27.63 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4400  inner-membrane translocator  30.04 
 
 
425 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  29.9 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  27.01 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1272  nucleoside ABC transporter membrane protein  29.78 
 
 
423 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0680  inner-membrane translocator  27.73 
 
 
420 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.529886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>