More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1686 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  74.93 
 
 		 696 aa  1050    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 698 aa  1397    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  38.47 
 
 		 707 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  33.05 
 
 		 706 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  34.39 
 
 		 732 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  32.45 
 
 		 715 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 706 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  33.7 
 
 		 492 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  33.41 
 
 		 469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  32.68 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  32.68 
 
 		 489 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  31.14 
 
 		 493 aa  226  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 744 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  41.15 
 
 		 1065 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  41.15 
 
 		 1065 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.83 
 
 		 385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 453 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25 
 
 		 453 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  25.12 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.54 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  23.58 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.35 
 
 		 464 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.09 
 
 		 440 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.32 
 
 		 531 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.66 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  25.98 
 
 		 466 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  27.8 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  29.56 
 
 		 551 aa  112  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  28.16 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.59 
 
 		 499 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 		 654 aa  111  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25.67 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.33 
 
 		 509 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  26.33 
 
 		 509 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.29 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  26.34 
 
 		 951 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 652 aa  106  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.15 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  25.55 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.42 
 
 		 488 aa  104  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.47 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 479 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 		 590 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  25.35 
 
 		 451 aa  101  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  26.76 
 
 		 451 aa  99.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  24.64 
 
 		 479 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 647 aa  96.7  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.53 
 
 		 531 aa  96.3  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  27.23 
 
 		 443 aa  96.3  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.18 
 
 		 650 aa  95.9  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  25.59 
 
 		 451 aa  94  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0451  DNA repair helicase  24.68 
 
 		 218 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000151647 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  23.19 
 
 		 1597 aa  78.6  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.76 
 
 		 905 aa  77.4  0.0000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  25.57 
 
 		 993 aa  76.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  21.46 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  23.87 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  24.16 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  24.77 
 
 		 889 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  21.8 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.42 
 
 		 633 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  20.81 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  19.95 
 
 		 843 aa  70.9  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.11 
 
 		 555 aa  70.1  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  19.85 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  20.1 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.04 
 
 		 949 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1255  DEAD/DEAH box helicase  25.6 
 
 		 811 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.171092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  23.86 
 
 		 761 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.29 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  23.33 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  24.18 
 
 		 770 aa  67.8  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  23.62 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1354  type III restriction enzyme, res subunit  22.59 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0575606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  22.81 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  18.83 
 
 		 479 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.64 
 
 		 952 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  23.15 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  21.82 
 
 		 1043 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  23.15 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  23.15 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  22.97 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 886 aa  64.7  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  20.62 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.74 
 
 		 813 aa  64.3  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  19.2 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.15 
 
 		 504 aa  63.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  23.19 
 
 		 550 aa  63.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.27 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  21.6 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  21.38 
 
 		 599 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  20.25 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 		 1055 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  20.77 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  20.83 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  23.97 
 
 		 1847 aa  62  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>