More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0729 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0682  homocysteine S-methyltransferase  44.33 
 
 		 793 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  51.75 
 
 		 774 aa  777    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  46.83 
 
 		 768 aa  680    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0729  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 781 aa  1556    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  54.93 
 
 		 780 aa  852    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  46.57 
 
 		 768 aa  691    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  37.31 
 
 		 804 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  38.5 
 
 		 807 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  38.68 
 
 		 791 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  34.24 
 
 		 804 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3258  homocysteine S-methyltransferase  33.57 
 
 		 841 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.728955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  35.29 
 
 		 801 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  32.6 
 
 		 813 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  33.37 
 
 		 804 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  34.46 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  33.71 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  33 
 
 		 804 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  33.05 
 
 		 811 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  34.29 
 
 		 806 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  33.5 
 
 		 819 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23490  methionine synthase (B12-dependent)  32.84 
 
 		 820 aa  441  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.136684  hitchhiker  0.0000158862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  32.64 
 
 		 841 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.28 
 
 		 816 aa  399  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0859  homocysteine S-methyltransferase  33.21 
 
 		 804 aa  392  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000329444  normal  0.146867 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  31.46 
 
 		 1215 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  31.07 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1442  homocysteine S-methyltransferase  33.12 
 
 		 802 aa  386  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.195548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1858  homocysteine S-methyltransferase  31.31 
 
 		 803 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  30.41 
 
 		 1223 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  31.91 
 
 		 804 aa  364  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  30.71 
 
 		 1189 aa  362  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27020  methionine synthase (B12-dependent)  29.59 
 
 		 1184 aa  355  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12372  normal  0.910685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2983  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.89 
 
 		 1132 aa  354  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5917  methionine synthase  29.58 
 
 		 1154 aa  352  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0712476  normal  0.0446229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4499  methionine synthase  29.08 
 
 		 1173 aa  351  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.629663  hitchhiker  0.00843884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.49 
 
 		 1132 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.37 
 
 		 1133 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.49 
 
 		 1132 aa  351  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.49 
 
 		 1133 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.49 
 
 		 1132 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0868  methionine synthase  31.01 
 
 		 1132 aa  349  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2031  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  29.54 
 
 		 1163 aa  349  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4366  methionine synthase  31.13 
 
 		 1132 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  30.89 
 
 		 1132 aa  348  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  31.01 
 
 		 1132 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1854  methionine synthase  28.99 
 
 		 1154 aa  345  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4108  methionine synthase  30.98 
 
 		 1132 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  29.7 
 
 		 1180 aa  345  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0085  methionine synthase (B12-dependent)  29.83 
 
 		 1150 aa  344  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.497685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1661  methionine synthase  30.42 
 
 		 1176 aa  343  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1825  methionine synthase (B12-dependent)  29.46 
 
 		 1158 aa  342  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0092  methionine synthase  29.48 
 
 		 1150 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0102  methionine synthase  29.6 
 
 		 1150 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0087  methionine synthase  29.82 
 
 		 1149 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.834345  normal  0.210518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2211  methionine synthase  29.02 
 
 		 1178 aa  338  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.22 
 
 		 839 aa  337  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2292  methionine synthase  27.61 
 
 		 1157 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0622799  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2325  methionine synthase  28.18 
 
 		 1171 aa  336  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0940297  hitchhiker  0.00240742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3230  methionine synthase  29.25 
 
 		 1183 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0032  methionine synthase  29.54 
 
 		 1196 aa  332  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.392993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3611  methionine synthase  28.97 
 
 		 1191 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.134345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2881  methionine synthase  27.58 
 
 		 1168 aa  331  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0934972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12156  5-methyltetrahydrofolate-homocystein methyltransferase metH  28.22 
 
 		 1192 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.726643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3052  methionine synthase (B12-dependent)  30.01 
 
 		 1178 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2495  methionine synthase  28.86 
 
 		 1191 aa  328  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0333  putative methionine synthase  28.97 
 
 		 1182 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10061  putative methionine synthase  29.32 
 
 		 1182 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0164665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1523  methionine synthase  29.94 
 
 		 1136 aa  326  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0723  methionine synthase  29.41 
 
 		 1151 aa  325  2e-87  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.830371  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2171  methionine synthase  27.68 
 
 		 1167 aa  325  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.657352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1355  methionine synthase (B12-dependent)  27.76 
 
 		 1208 aa  325  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.290102  normal  0.418289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1549  methionine synthase  28.49 
 
 		 1156 aa  323  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.217391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5363  methionine synthase  28.61 
 
 		 1169 aa  322  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.816675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0707  methionine synthase  29.41 
 
 		 1136 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1123  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.02 
 
 		 1208 aa  321  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00712875  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14891  putative methionine synthase  28.62 
 
 		 1214 aa  320  5e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.123192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1174  methionine synthase (B12-dependent)  27.38 
 
 		 1158 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2445  methionine synthase  28.1 
 
 		 1199 aa  317  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.795669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2133  methionine synthase  28.81 
 
 		 1169 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1372  methionine synthase (B12-dependent)  28.91 
 
 		 1190 aa  315  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.477278 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1418  methionine synthase  28.62 
 
 		 1181 aa  315  2.9999999999999996e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.156555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08871  putative methionine synthase  27.43 
 
 		 1191 aa  313  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  28.23 
 
 		 1266 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1940  methionine synthase  29.07 
 
 		 1193 aa  313  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.092673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3474  B12-dependent methionine synthase  28.31 
 
 		 1251 aa  312  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0923  putative methionine synthase  28.99 
 
 		 1188 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1488  methionine synthase  29.01 
 
 		 1156 aa  312  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.128181  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09841  putative methionine synthase  29.02 
 
 		 1188 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3053  B12-dependent methionine synthase  28.05 
 
 		 1251 aa  310  5e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.453999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  28.44 
 
 		 1235 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  28.44 
 
 		 1235 aa  310  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  28.21 
 
 		 1235 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  28.34 
 
 		 1236 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  28.1 
 
 		 1243 aa  309  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1700  methionine synthase  26.74 
 
 		 1171 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2786  methionine synthase  28.64 
 
 		 1195 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000283973  hitchhiker  0.0000102663 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09591  putative methionine synthase  27.94 
 
 		 1187 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09821  putative methionine synthase  29.61 
 
 		 1188 aa  308  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  28.4 
 
 		 1239 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  27.93 
 
 		 1263 aa  306  7e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>