More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0032 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  61.96 
 
 		 186 aa  228  3e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  59.68 
 
 		 194 aa  227  7e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  59.68 
 
 		 194 aa  227  7e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  39.88 
 
 		 209 aa  128  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1742  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2477  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00508365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0813  isochorismatase hydrolase  30.38 
 
 		 199 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3964  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3781  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0487  isochorismatase hydrolase  30.34 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  31.21 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  27.81 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3627  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4740  isochorismatase hydrolase  29.05 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3837  isochorismatase hydrolase  29.78 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  26.82 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  26.55 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5543  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3854  isochorismatase hydrolase  28.03 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.320846  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1017  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.802733  normal  0.0972832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4163  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.256944 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  25.7 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3936  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  29.73 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  31.11 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0290  isochorismatase hydrolase  28.65 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  26.38 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.5 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3884  isochorismatase hydrolase  27.23 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  22.77 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  26.38 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  31.17 
 
 		 359 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3931  isochorismatase hydrolase  26.75 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.835033  normal  0.1743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 329 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  26.37 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3916  isochorismatase hydrolase  26.75 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3990  isochorismatase hydrolase  26.75 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2540  isochorismatase hydrolase  27.39 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.417405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  22.84 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0291  isochorismatase hydrolase  29.21 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  25.89 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  29.57 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4313  isochorismatase hydrolase  28.28 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.168777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0338  isochorismatase hydrolase  31.16 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.17 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21200  Isochorismatase (2,3 dihydro-2,3 dihydroxybenzoate synthase)  27.42 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0178393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  30.27 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  29.51 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  30.27 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0908  isochorismatase hydrolase  28.16 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150668  normal  0.249325 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  25.89 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  30.27 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2039  isochorismatase family protein  26.32 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0251  isochorismatase family protein  34.31 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  31.39 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2963  isochorismatase family protein  29.2 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  30.27 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  28.29 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  29.73 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1849  isochorismatase hydrolase  26.74 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.605673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  32.12 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  29.73 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  26.23 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  27.22 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4372  isochorismatase hydrolase  27.32 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0306857  normal  0.52694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0340  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  29.73 
 
 		 295 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0383  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0356  isochorismatase family protein  27.93 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0342  isochorismatase family protein  28.65 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 		 342 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>