111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0060 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  39.6 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  145  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  33.16 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  34.34 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  32.63 
 
 		 205 aa  115  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  38.94 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  34.72 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  38.27 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  33.99 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  33.5 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  33.5 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  31.37 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  31.34 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  31.28 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  31 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  31.66 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  31 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  31 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  35.94 
 
 		 192 aa  91.7  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  30.35 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  27.57 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  35.42 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  24.74 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  27.18 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  29.02 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  31.55 
 
 		 215 aa  78.6  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  31.41 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  34.36 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  30.65 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  32.5 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.86 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  32.81 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  25.39 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  30.52 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  26.5 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  27 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  30.92 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  32.12 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  28.25 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  24.08 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  26.7 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  26.5 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  24.86 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  26 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  29.95 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  31.55 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  34.06 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  26.72 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  26.19 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  30.94 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  26.9 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  29.32 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  26.94 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  27.55 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  27.55 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  27.55 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  27.04 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  30.39 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  37.17 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  31 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  30.17 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  30.17 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  26.42 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  30 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  28.64 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  26.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  26.15 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  24.75 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  26.15 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  25.52 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  25.52 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  23.83 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  27.49 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  25 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0784  hypothetical protein  27.36 
 
 		 240 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  32.79 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  29.91 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  24.63 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>