78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0526 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  80.68 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  70.73 
 
 		 207 aa  317  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  66.02 
 
 		 207 aa  293  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  62.75 
 
 		 206 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  62.25 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  62.25 
 
 		 206 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  60.29 
 
 		 206 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  60.78 
 
 		 206 aa  263  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  60.78 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  62.75 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  60.78 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  60.61 
 
 		 206 aa  258  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  58.33 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  43.9 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  46.23 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  34.87 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  36.08 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  34.69 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  33.85 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  29.59 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  27.89 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  27.64 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  27.64 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  30.1 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  26.53 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  28.64 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  32.14 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  27.14 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  26.63 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  26.63 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  26.02 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  25.25 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  28.64 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  27.45 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  27.32 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  25.15 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  28.43 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  25.24 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.13 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  24.17 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  24.64 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  23.9 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  22.64 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  23.76 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  23.2 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27.07 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  26.67 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  26.32 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  24.81 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  20.2 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  21.65 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  28.7 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  21.13 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  21.5 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  22.94 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  25.22 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  24.04 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  25.44 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  26.45 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  19.07 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  20.1 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  25.21 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>