69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4358 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  99 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  99.5 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  98.51 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  88.56 
 
 		 201 aa  358  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  88.06 
 
 		 201 aa  357  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  87.56 
 
 		 201 aa  353  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  83.58 
 
 		 201 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  57.29 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  56.78 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  54.77 
 
 		 211 aa  218  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  48.82 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  49.76 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  51.26 
 
 		 202 aa  204  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  49.75 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  41.41 
 
 		 207 aa  164  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  41.67 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  38.31 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  38.31 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  34.18 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  32.82 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  29.53 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  27.55 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  28.64 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  27.46 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  27.46 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  27.46 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  27.46 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  29.91 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  32.02 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  32.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  32 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  30.39 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  26.29 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  26.44 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.44 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  28.49 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  27.54 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  26.02 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  26.02 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  25.51 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.08 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  25.98 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  23.76 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  25.26 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  25.52 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  22.11 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.77 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  22.11 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  23.68 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  25.77 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  29.25 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>