80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0460 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  59.51 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  54.85 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  55.98 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  55.5 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  55.02 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  52.43 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  52.91 
 
 		 206 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  52.94 
 
 		 206 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  52.43 
 
 		 206 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  51.69 
 
 		 205 aa  214  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  47.74 
 
 		 207 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  48.24 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  46.23 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  45.45 
 
 		 207 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  43.2 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  33.84 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  31.63 
 
 		 211 aa  98.6  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  29.95 
 
 		 216 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  31.95 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  29.08 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  28.8 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  29.26 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  28.92 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  32.08 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  27.13 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  29.48 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  26.43 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  26.19 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  24.86 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  24.88 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  29.79 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  29.08 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  26.02 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.67 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  26.11 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  23.12 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  23.12 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  24.88 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  21.94 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  26.15 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  28.99 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  28.99 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  28.99 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  20.32 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  22.11 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  23.58 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.19 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  20.86 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  22.22 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  29.85 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  23.58 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  20.86 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  22.64 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  20.71 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  40.82 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  20.92 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  26.09 
 
 		 224 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  35.09 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>