79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4116 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  36.51 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  30.6 
 
 		 206 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  30.98 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  32.97 
 
 		 214 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  31.87 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 208 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  32.42 
 
 		 214 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  31.32 
 
 		 208 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  31.32 
 
 		 208 aa  91.3  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  30.69 
 
 		 215 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  29.28 
 
 		 206 aa  84.3  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  30.81 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  31.79 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  29.1 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  29.1 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  30.62 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  30.64 
 
 		 220 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  29.55 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  29.47 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  31.06 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  29.1 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  32.2 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  31.5 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  27.01 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  31.02 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  23.91 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  31.02 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  26.34 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  29.41 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  29.31 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  25.32 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  29.73 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.54 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  41.38 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  30.17 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  31.47 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.54 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  29.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  29.59 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  26.22 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  29.58 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  29.58 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.49 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  26.34 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  29.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  29.06 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  28.28 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  30.09 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  25.81 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  24.73 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  25.81 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  25.25 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  28.47 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.99 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  25.47 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  26.26 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  29.41 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  25.98 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  28.44 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  27.41 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  26.24 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  27.72 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  28.44 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  26.74 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  25.52 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>