47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5459 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  423  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  72.73 
 
 
192 aa  269  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  72.73 
 
 
192 aa  269  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  74.29 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  78.16 
 
 
197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  57.59 
 
 
190 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  62.21 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  55.62 
 
 
231 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  51.48 
 
 
201 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  38.55 
 
 
172 aa  99.8  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  36.3 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  33.59 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  31.3 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  31.3 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  31.3 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  31.3 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  31.85 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  31.85 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  31.11 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  32.82 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  31.88 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  33.06 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  29.71 
 
 
224 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  29.71 
 
 
215 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  36.22 
 
 
196 aa  61.6  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  34.35 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  31.3 
 
 
189 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  33.62 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  36.57 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  37.31 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  32.12 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  31.25 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  30.36 
 
 
203 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  29.01 
 
 
211 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  26.89 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  36.51 
 
 
207 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  29.1 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.34 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  36.54 
 
 
207 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>