51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0376 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 
214 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  83.18 
 
 
214 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  84.58 
 
 
214 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  74.4 
 
 
208 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  74.4 
 
 
208 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  74.4 
 
 
208 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  73.91 
 
 
208 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  73.43 
 
 
208 aa  305  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  74.88 
 
 
208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  73.91 
 
 
208 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  71.84 
 
 
215 aa  293  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  70.39 
 
 
215 aa  284  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  70.39 
 
 
215 aa  284  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  70.39 
 
 
215 aa  284  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  70.39 
 
 
215 aa  284  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  70.39 
 
 
224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  69.9 
 
 
215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  45.79 
 
 
223 aa  158  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  44.17 
 
 
222 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  45.76 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  45.76 
 
 
220 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  43.72 
 
 
203 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  42.33 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  37.62 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  35.98 
 
 
206 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  33.51 
 
 
193 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  34.62 
 
 
189 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  30.39 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  39.13 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  36.57 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  34.48 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  35.43 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  33.06 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  38.21 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  39.34 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  34.17 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.16 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  31.65 
 
 
172 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  26.99 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  28.35 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  23.15 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  25.51 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  31.2 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  25.52 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  27.27 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  29.6 
 
 
202 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  27.46 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  24.61 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  26.57 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.76 
 
 
207 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>