66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1895 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  79.61 
 
 		 206 aa  322  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  39.2 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  37.31 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 214 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  35.53 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  34.85 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  34.34 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  34.34 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  34.15 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  33.84 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  30.6 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  32.72 
 
 		 224 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  33.49 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  34.05 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  33.02 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  28.98 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  28.43 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  29.74 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  31.85 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  26.26 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  25.39 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  32.37 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  25.7 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  30.37 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  32.23 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  25.77 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  35.16 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  31.06 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  31.06 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  30.37 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  29.49 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  33.64 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  27.75 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  25.27 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  26.32 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  26.42 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  24.07 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  22.16 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  23.58 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.63 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  25.45 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  26.02 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  29.91 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  25.89 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  25.22 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  25.89 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.94 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  32.46 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  24.51 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  27.18 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  24.62 
 
 		 220 aa  41.6  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>