47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1293 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  63.95 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  57.92 
 
 		 192 aa  205  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  56.83 
 
 		 192 aa  203  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  60.34 
 
 		 190 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  55.75 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  60.82 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  54.02 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  64.74 
 
 		 197 aa  190  9e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  38.16 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  36.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  31.58 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  31.85 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  30.53 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  29.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  29.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  29.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  30.95 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  31.75 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  30.37 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  30.43 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  30.34 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  27.01 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  36.75 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  28.8 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  28.36 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  32.73 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  35.2 
 
 		 222 aa  51.2  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  27.21 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  28.17 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  34.85 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  28.05 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  32.54 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.77 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  40.43 
 
 		 203 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>