51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0373 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  77.58 
 
 		 222 aa  311  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  58.2 
 
 		 203 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  53.14 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  54.33 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  45.79 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  47.03 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  46.51 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  41.94 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  41.94 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  41.94 
 
 		 208 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  41.94 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  41.94 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  41.01 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  41.01 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  41.98 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  41.35 
 
 		 215 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  41.35 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  41.35 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  41.35 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  41.35 
 
 		 215 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  39.42 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  38.61 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  33.66 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  28.43 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  33 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  30.62 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  29.57 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.92 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  41.23 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  35.25 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  35.25 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  27.52 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  36.21 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  33.62 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  36.75 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  36.21 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  35.65 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  34.78 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  31.55 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  29.25 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  32.49 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  32.48 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.77 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  23.71 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  23.71 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  26.34 
 
 		 192 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  28.64 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  26.71 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  28.29 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>