58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0335 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 220 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  98.18 
 
 		 220 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  83.33 
 
 		 203 aa  308  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  53.81 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  53.81 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  44.79 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  44.79 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  44.79 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  44.79 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 208 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  44.21 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  43.68 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  40.82 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  40.1 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  38.78 
 
 		 215 aa  138  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  40.31 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  42.78 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  35.75 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  32.45 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  32.79 
 
 		 189 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  27.96 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  26.2 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  36.78 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  39.86 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  25.63 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  37.69 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  39.23 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  37.21 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  31.22 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  38.02 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  37.8 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  31.63 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  34.9 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  34.23 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  28.95 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  29.63 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  31.18 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  21.43 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  27.57 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  30.66 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  28.99 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  25 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  26.6 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  32.74 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  28.16 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  20.97 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  20.97 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  27.6 
 
 		 205 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>