65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02770 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  70.62 
 
 
211 aa  251  6e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  67.46 
 
 
215 aa  243  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  66.03 
 
 
215 aa  237  8e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  35.42 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  29.06 
 
 
205 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  29.21 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  33.66 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  31.5 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  31.44 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  26.09 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  26.09 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  29.8 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  29.06 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  30.58 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  31.07 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  29.38 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  29.38 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  30.1 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  34.45 
 
 
211 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  28.23 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  30.05 
 
 
207 aa  55.1  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  31.55 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  30.6 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.04 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  23.36 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  25.96 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27.18 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27.18 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  30.6 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.18 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  28.44 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  23.94 
 
 
235 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  28.93 
 
 
205 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  27.08 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  28.91 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  26.4 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  33.01 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  28.5 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  29.47 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  32 
 
 
196 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  26.32 
 
 
206 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  29.05 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  29 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  23.74 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  29.53 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0712  hypothetical protein  26.92 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  27.1 
 
 
214 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  28 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  27.59 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  22.94 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  27.1 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0784  hypothetical protein  25 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  24.88 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  26.74 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  27.18 
 
 
206 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  28.27 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  26.57 
 
 
214 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0687  hypothetical protein  25.24 
 
 
231 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  27.59 
 
 
211 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>