68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1600 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  79.61 
 
 		 206 aa  338  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  35.96 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  35.79 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  35.64 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  38.31 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  35.68 
 
 		 193 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  35.26 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  35.26 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  34.04 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  33.98 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  33.01 
 
 		 224 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  33.9 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  33.01 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  29.51 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  33 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  29.9 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  27.17 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  36.17 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  35.29 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  28.09 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  27.53 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  39.83 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  34.81 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  27.08 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  31.58 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  35.61 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  35.61 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  34.35 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  34.59 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  30.73 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  30.26 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  32.65 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  31.84 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  28.06 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  31.5 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  25 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  27.36 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  28.89 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.57 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  29.47 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.92 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  21.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  21.83 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  25.27 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  22.45 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  24.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  24.04 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  22.64 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  30.43 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  22.99 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  32.38 
 
 		 207 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  32.38 
 
 		 207 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  32.38 
 
 		 207 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>