39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0869 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  99.48 
 
 
192 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  74.86 
 
 
212 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  72.41 
 
 
196 aa  246  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  70.69 
 
 
197 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  60 
 
 
190 aa  215  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  56.28 
 
 
184 aa  193  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  50.59 
 
 
201 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  50.59 
 
 
231 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  37.82 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  34.88 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  37.5 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  36.72 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  35.94 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  35.94 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  35.94 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  36.29 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  35.94 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  34.88 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  36.36 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  35.61 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  34.35 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  35.11 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  39.34 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  35.11 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  31.06 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  37.04 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  37.04 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  36 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  35.34 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  30.77 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  34.15 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  34.71 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  32.43 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>