55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4048 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  92.06 
 
 		 214 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  84.58 
 
 		 214 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  71.98 
 
 		 208 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  71.98 
 
 		 208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  71.98 
 
 		 208 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  71.98 
 
 		 208 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  72.95 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  72.95 
 
 		 208 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  70.05 
 
 		 208 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  68.93 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  68.45 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  68.45 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  68.45 
 
 		 224 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  68.45 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  68.45 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  67.96 
 
 		 215 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  46.51 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  42.93 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  43.26 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  40.98 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  43.26 
 
 		 220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  41.27 
 
 		 193 aa  128  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  39.2 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  39.06 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  32.6 
 
 		 196 aa  99  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  31.89 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  32.42 
 
 		 189 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  40.87 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  40.65 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  35.42 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  33.86 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  40.46 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  32.26 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  32.56 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  33.91 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  36.75 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  28.04 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.79 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  26.46 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  46.15 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  29.81 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  28.85 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  30.4 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  28.65 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  26.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  23.04 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  24.49 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  24.87 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  27.1 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  26.18 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  24.86 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.8 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>