85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0453 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  93.24 
 
 		 207 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  92.75 
 
 		 207 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  93.24 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  73.91 
 
 		 207 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  65.22 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  65.7 
 
 		 207 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  64.97 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  60.87 
 
 		 207 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  61.42 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  60.41 
 
 		 208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  32.65 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  30.1 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  33.67 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  25.76 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  25.76 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  27.37 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  30.24 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  23.86 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  24.12 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  23.23 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  27.78 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  22.73 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  27.37 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  25.26 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  27.66 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  23.12 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  28.5 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  25.79 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  22.51 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  23.56 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  23.47 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  26.84 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  24.74 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  29.15 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  27.27 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  30.88 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  25.51 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  27.78 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  25.39 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  28.88 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  27.89 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  25.26 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  24.21 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  24.74 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  23.68 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  26.52 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  25.26 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  25.26 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  26.19 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  33.57 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  22.05 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  22.22 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  26.47 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  24.81 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.29 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  27.08 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  23.53 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  31.43 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  25.16 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  21.94 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  23.81 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  22 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  20.81 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  20.32 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  24.73 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  27.32 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  33.33 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  22.99 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  24.32 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  26.98 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>