52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0401 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  32.45 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  32.45 
 
 		 204 aa  91.7  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  27.18 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.63 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  26.63 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  26 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  22.92 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  25.77 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  31.07 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  23.74 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.4 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  25.77 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  25.12 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  23.36 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  26.15 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  21.54 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  21.54 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  22.05 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  25.38 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  21.03 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  23.67 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  23.23 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  20.67 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  31.09 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  24.64 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  29.13 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  25.56 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  26.21 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  26.92 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  24.2 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  21.43 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  20.6 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  20.98 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  20.5 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  25.96 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  24.53 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  21.83 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.79 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  21.83 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  27.72 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  22.34 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  22.34 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  22.95 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  20.3 
 
 		 208 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  20.3 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  20.3 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>