65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2701 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  24.74 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  24.27 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  30.15 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  25.95 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  25.24 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  25.39 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  21.65 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  23.2 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  23.2 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  23.2 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  29.8 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  22.68 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  22.68 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  25.77 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.26 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  26.11 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  23.72 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0174  Sterol-binding domain protein  28.65 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  28.36 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  29.13 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  24.49 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  26.02 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  21.76 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  25.77 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  21.76 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  28.64 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  22.68 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  23.27 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  22.16 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  28.92 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  28.43 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  26.47 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  22.22 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  22.96 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  25.49 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  25.98 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4131  hypothetical protein  26.77 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000668989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  25.74 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  25.98 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  25.98 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  25 
 
 		 201 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  22.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  24.02 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  27.94 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  26 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  25.12 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  20.2 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  22.49 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  21.72 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  20.5 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  20.4 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  22.11 
 
 		 235 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>