30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0102 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  100 
 
 		 211 aa  403  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  34.72 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  34.36 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  28.36 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  27.5 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  29.63 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  34.45 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1191  hypothetical protein  31.25 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  29.14 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  30.86 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  21.57 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  30.29 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  32.48 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  21.57 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  25.56 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1099  sterol-binding domain-containing protein  29.17 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  38.57 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  27.32 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  32.32 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  31.21 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  30.94 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  24.62 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  22.84 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  22.84 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  40 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  22.84 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  24.63 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>