86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00563 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  90.43 
 
 		 211 aa  401  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  73.5 
 
 		 207 aa  324  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  57.29 
 
 		 207 aa  241  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  43.59 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4251  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3959  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4179  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4202  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4298  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4358  hypothetical protein  38.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  37.81 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  37.81 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0272  hypothetical protein  38.07 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3944  sterol-binding domain-containing protein  37.56 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3640  hypothetical protein  37.06 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3914  Sterol-binding domain protein  36.87 
 
 		 202 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3793  sterol-binding domain-containing protein  37.44 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0444  Sterol-binding domain protein  38.02 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4097  hypothetical protein  34.34 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0249  sterol-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.300084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0418  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0526  sterol-binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0430  sterol-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.493767  hitchhiker  0.0000569108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3374  hypothetical protein  32.5 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.581541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0474  hypothetical protein  37.95 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  41.18 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4200  hypothetical protein  36.68 
 
 		 205 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0505  hypothetical protein  36.73 
 
 		 206 aa  121  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3762  Sterol-binding domain protein  34.85 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  31.96 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3552  hypothetical protein  35.64 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3726  hypothetical protein  35.68 
 
 		 206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4055  Sterol-binding domain protein  33.97 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0404  hypothetical protein  35.18 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.459828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  33.81 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4246  Sterol-binding domain protein  34.41 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3203  hypothetical protein  33.53 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.663058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  31.34 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0460  hypothetical protein  31.95 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.13 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.63 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  25.85 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  25.77 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  25.77 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  28.24 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0596  hypothetical protein  25.12 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.307135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2701  hypothetical protein  24.49 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000952725 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  27.94 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  23.96 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  21.47 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  26.96 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  25.25 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  25.12 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  28.36 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  25.98 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  28.35 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  22.77 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  28.32 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  24.02 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  24.02 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  27.4 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  23.53 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  29.46 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1187  Sterol-binding domain protein  24.77 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.044865  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  27.56 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02770  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.763471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  26.24 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  22.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  28.69 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3416  hypothetical protein  22.92 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  30.84 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  21.11 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  21.11 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  24.32 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  22.86 
 
 		 207 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0102  Sterol-binding domain protein  24.63 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>